سرگرد اقبالى در ۱ آبان ۱۳۵۹ در یک ماموریت برون‌مرزی به عنوان لیدر با هدف بمباران یکی از سایت‌های رادار شهر [[موصل]] اعزام شد. دو فروند هواپیمای اف-۵ پس از رسیدن به منطقه و عدم مشاهده هدف نخست برای بمباران پادگان العقره در حوالی پایگاه هوایی کرکوک به عنوان هدف دوم، تغییر مسیر دادند. پس از بمباران این پادگان، در راه بازگشت هواپیمای وى مورد اصابت موشک قرار گرفت و در ۳۰ کیلومتری شرق موصل پس از اجکت ،اجکت، سقوط کرد.
پس از سقوط هواپیمای وی و دستگیری استاد خلبان ٣١ ساله در عراق، بدستور موكدموکد [[صدام حسین]] مبنيمبنی بر برخورد شديدشدید با خلبانان و فرماندهانيفرماندهانی كهکه ليستشانلیستشان در فهرست سياهسیاه ارتش عراق بود بدليلبدلیل ضربات مرگباريمرگباری كهکه ايناین خلبان به نيروهاينیروهای عراقيعراقی وارد اورده بود توسط يگانهايیگانهای بعثيبعثی در محل استقرار نيروهاينیرو‌ها، بدنش را به دو نیم کرده انگاهآنگاه نیمی را در گورستان محافظیه شهر [[نینوا]] و نیمه دیگر آن را در قبرستان زبیر شهر [[موصل]] به خاک سپرده شود. پس از ۲۲ سال و با پیگیری کمیته جستجوی اسرا و مفقودین و کمیته بین‌المللی [[صلیب سرخ]]، در پنجم مرداد سال ۸۱ بازمانده پیکر سید علی اقبالی دوگاهه به ایران بازگشت و در قطعه شهدای جنگ ایران و عراق بهشت زهرا به خاک سپرده شد.<ref>[http://www.afsaran.ir/site/click/113595?url=http%3A%2F%2Fwww.mashreghnews.ir%2Ffa%2Fnews%2F135786%2F%25D8%25AC%25D9%2588%25D8%25A7%25D9%2586%25D8%25AA%25D8%25B1%25DB%258C%25D9%2586-%25D8%25A7%25D8%25B3%25D8%25AA%25D8%25A7%25D8%25AF-%25D8%25AE%25D9%2584%25D8%25A8%25D8%25A7%25D9%2586-%25D8%25A7%25DB%258C%25D8%25B1%25D8%25A7%25D9%2586%25DB%258C-%25D8%25AA%25D8%25B5%25D9%2588%25DB%258C%25D8%25B1 مشرق-جوانترین استاد خلبان ایرانی]</ref><ref>[http://www.navideshahed.com/fa/index.php?Page=definitionnews&UID=358670 نویدشاهد-جوان ترین استاد خلبانی ارتش چگونه کشته شد؟]</ref>
