ریشه نام سیکیم را از ترکیب دو واژه «سو» و «خییم» در زبان نپالی [[زبان لیمبو|لیمبو]] دانسته‌اند که واژه اولی به معنای نو و دومی به معنای سرای است. گفته می‌شود که «سرای نو» به کاخ نخستین فرمانروای این منطقه یعنی [[فونتسوگ نامگیال]] اشاره دارد. نام تبتی برای سیکیم، «درنجونگقویوم» و به معنی «دره برنج» است.<ref name="sikkimtourismintro"/> مردم لپچا، که ساکنان اصلی سیکیم هستند این سرزمین را «نیه-مائه-اِلداشاخ» می‌نامیدند که به معنی «بهشت» است.<ref name="sikkimtourismintro">{{Cite web | title = Welcome to Sikkim - General Information | publisher = Sikkim Tourism, Government of Sikkim | url = http://www.sikkimtourism.travel/Webforms/General/Introduction.aspx | accessdate =16 May 2008}}</ref> در تاریخ‌نامه‌ها، سیکیم را ایندراکیل می‌نامیدند، به معنای «باغ ایندرا (ایزد جنگ).»<ref>{{Cite book | title = Encyclopaedia of Indian literature vol. 2 | last = Datta | first = Amaresh | origyear = 1988 | year = 2006 | publisher = Sahitya Akademi | location = | isbn = 81-260-1194-7 | page = 1739}}</ref>
