جامعه روحانیت مبارز در نخستین انتخابات ریاست جمهوری ایران از جمله حامیان [[ابوالحسن بنیصدر|ابوالحسن بنیصدر]] بود.<ref>{{یادکرد وب|نام خانوادگی=جهان{{!}}TABNAK|نام=سایت خبری تحلیلی تابناك{{!}}اخبار ایران و|کد زبان=fa-IRخبر|نشانی=http://www.tabnak.ir/fa/news/45516/%D8%B1%D9%88%D8%A7%D9%86%D8%A8%D8%AE%D8%B4-%D8%AC%D8%A7%D9%85%D8%B9%D9%87-%D8%B1%D9%88%D8%AD%D8%A7%D9%86%DB%8C%D8%AA-%D8%A7%D8%B2-%D8%A8%D9%86%DB%8C-%D8%B5%D8%AF%D8%B1-%D9%87%D9%85-%D8%AD%D9%85%D8%A7%DB%8C%D8%AA-%DA%A9%D8%B1%D8%AF%D9%87|عنوان=روانبخش: جامعه روحانیت از بنی صدر هم حمایت کرده| ناشر =سایت خبری تحلیلی تابناك|تاریخ =۸ اردیبهشت ۱۳۸۸|تاریخ بازبینی=2017-12-05 }}</ref> این حمایت تا مدتی نیز ادامه داشت، به نحوی که در جریان تصویب اعتبارنامه [[سید حسن آیت|حسن آیت]] در [[دوره نخست مجلس شورای اسلامی|مجلس اول]]، کهماجراهایی رخ داد. خلاصه ماجرا به خاطراین انتشارشرح بود که حسن آیت بر ضد بنیصدر سخنانی را گفته بود. نوار سخنرانیسخنان اوحسن آیت بر علیه بنیصدر موردمنتشر اعتراضشد. قرارپس گرفتهاز انتشار نوار سخنان حسن آیت بر علیه بود،بنیصدر، بعضی از روحانیوننمایندگان مخالفروحانی مجلس اول با تصویب اعتبارنامه حسن آیت بودندبعنوان نماینده مردم در مجلس، مخالفت کردند. رای‌گیریرأی‌گیری علنی برای تصویب اعتبارنامه حسن آیت منجر به تقدیم استعفای دو تن از روحانیون نماینده مجلس اول، به نام‌های [[محمدباقر انواری|محی‌الدین انواری]] و [[محمد شجاعی]] انجامیدشد. [[اکبر هاشمی رفسنجانی|رئیس وقت مجلس شورای اسلامی]] در این جلسه به [[فضل‌الله محلاتی|]]، دبیر وقت جامعه روحانیت مبارز]] اجازه صحبت نداد.<ref>{{یادکرد ژورنال|عنوان=مشروح مذاکرات مجلس شورای اسلامی|ژورنال=روزنامه رسمی|شماره=11024|ناشر=کتابخانه مجلس|تاریخ=02/05/1359|صفحه=21-23|زبان=fa|شاپا=|doi=|پیوند=|تاریخ دسترسی=}}</ref>
