بعد از درگذشت مرجع عامه وقت آیت الله سید [[ابوالحسن اصفهانی]]، حسین طباطبایی قمی راهی [[نجف]] شد. علما و مجتهدان نجف اشرف با از دست دادن آیت الله اصفهانی در پی مرجع عام دیگری، برای سپردن مرجعیت عامه شیعیان و سرپرستی [[حوزه علمیه نجف]] به او بودند و تنها شخصیت ارزنده و والامقام حضرت آیت الله سید حسین طباطبایی قمی را لایق این مسؤولیت می‌دانستند. پس از اصرار فراوان ایشان چاره‌ای جز قبول مسوولیت ندید ووی با در دست گرفتن این امر خطیرموضوع موافقت کرد.<ref name="ahl-ul-bait.org" /><ref name="tebyan.net" />
