به اعتقاد ملکیان،به هر دین تاریخی و نهادینه ای التزام صد در صد داشتن با عقلانیت ناسازگار است چون هر دین تاریخی و نهادینه ای از من تعبد می طلبد، می خواهد من سخن کس یا کسان را بپذیرم[بدون استدلال]
به اعتقاد ملکیان، نقطه قوت دین آن است که بر تحول درونی تأکید می‌کند و تحول بیرونی را منوط به تحول درونی می‌داند. بدفهمی‌هایی که از دین صورت می‌گیرد عبارتند از: ۱. دین داری را به معنای مالکیت حقیقت بگیریم؛ ۲. تعبّد؛ ۳. تلقی صرفاً منطقی از بحث توحید؛ ۴. حجره حجره کردن دین و خلاصه کردن آن در یک یا چند حجره؛ ۵. مطلوبیت ذاتی قائل شدن برای عبادت و ۶. بی صداقتی. این بدفهمی‌ها منشأ رفتارهای نادرست اجتماعی است.<ref>[http://www.hawzah.net/FA/articleview.html?ArticleID=88287 تأثیرات اجتماعی فهم نادرست از دین]</ref>
