علی سلمان در روز یکشنبه ۲۸ دسامبر ۲۰۱۴ پس از انتخاب دوباره برای تصدی دبیرکلی [[جمعیت وفاق ملی اسلامی|جمعیت الوفاق]]، به مقر وزارت کشور بحرین احضار شده و توسط نیروهای امنیتی بازداشت شد.<ref name="ایسنا">{{یادکرد وب | نشانی=https://www.isna.ir/news/93100804191/شیخ-علی-سلمان-کیست | عنوان=شیخ علی سلمان کیست؟ | ناشر=[[ایسنا]] | تاریخ=۸ دی ۱۳۹۳}}</ref> پس از هفت ماه [[حبس]] و با وجود درخواستهای بینالمللی، در روز ۱۶ ژوئن ۲۰۱۵ دادگاهی در بحرین او را به چهار سال زندان محکوم کرد.<ref name="جام">{{یادکرد وب | نشانی=http://w.magiran.com/npview.asp?ID=3176200 | عنوان=شیخ علی سلمان به ۴ سال زندان محکوم شد | ناشر=[[Magiran.com]] | اثر=[[روزنامه جام جم]] | بازبینی=27 خرداد 1394}}</ref> علی سلمان در این دادگاه از اتهام تلاش برای براندازی نظام تبرئه شد؛ اما اتهامات دیگری از جمله توهین به وزارت کشور و دعوت برای سرپیچی از قوانین، به او نسبت داده شد که منجر به صدور این حکم گشت.<ref name="جام"/>
صدور این حکم با واکنشهای مختلف و محکومیت بین المللیبینالمللی مواجه شد.<ref name="سیما">{{یادکرد وب | نشانی=http://www.iribnews.ir/fa/news/85391/زندانیان-سیاسی-بحرین-آزاد-شوند | عنوان=زندانیان سیاسی بحرین آزاد شوند | ناشر=[[خبرگزاری صدا و سیما]] | تاریخ=۲۸ خرداد ۱۳۹۴}}</ref> [[اتحادیه اروپا]] با صدور بیانیهای ضمن انتقاد از صدور حکم زندان طولانی مدت برای علی سلمان توسط حکومت بحرین، خواستار بازنگری در حکم شد و صدور چهار سال زندان برای او را ناقض تلاشها برای آشتی ملی در بحرین دانست.<ref name="سیما"/> [[سازمان عفو بینالملل]] نیز با صدور بیانیه ای ضمن تاکید بر اینکه شیخ علی سلمان زندانی عقیدتی است، اعلام کرد که رژیم بحرین باید فورافوراً او را آزاد کند.<ref>{{یادکرد وب | نشانی=http://www.irna.ir/fa/News/82946805 | عنوان=سازمان عفو بین المللبینالملل خواستار آزادی فوری شیخ علی سلمان شد | ناشر=[[ایرنا]] | تاریخ=۲۹ خرداد ۱۳۹۷}}</ref>
=== حبس ابد ===
یکی از اتهاماتی که به علی سلمان و دو تن از نمایندگان سابق پارلمان بحرین و اعضای جمعیت الوفاق به نامهای «حسن سلطان» و «علی الاسود» نسبت داده شد، اتهام جاسوسی برای قطر در پی افشای یک مکالمه بین سلمان و [[حمد بن جاسم بن جبر آل ثانی|حمد بن جاسم آل ثانی]] نخست وزیر سابق قطر در مارس ۲۰۱۱ در چارچوب «طرح آمریکایی برای حل بحران بحرین» بود که دادستان بحرین در روز ۲۱ ژوئن ۲۰۱۸ این سه نفر را از این اتهام نیز تبرئه نموده<ref name="تبرئه">{{یادکرد وب | نشانی=https://www.isna.ir/news/97033115026/علی-سلمان-از-اتهام-جاسوسی-برای-قطر-تبرئه-شد | عنوان=علی سلمان از اتهام جاسوسی برای قطر تبرئه شد | ناشر=[[ایسنا]] | تاریخ=۳۱ خرداد ۱۳۹۷}}</ref><ref name="جم">{{یادکرد وب | نشانی=http://jamejamonline.ir/online/3338660992416169361 | عنوان=رهبر جمعیت الوفاق بحرین تبرئه شد | ناشر=[[جام جم آنلاین]] | تاریخ=31 خرداد 1397}}</ref>و اعلام کرد که نسبت به حکم تبرئه در دادگاه تجدیدنظر اعتراض خواهد کرد.<ref name="تبرئه"/> در ۲۴ اکتبر ۲۰۱۸ دادگاه بحرین حکم تبرئه این سه شهروند بحرینی از اتهام جاسوسی برای [[قطر]] را لغو و ایشان را به [[حبس ابد]] محکوم کرد.<ref>{{یادکرد وب | نشانی=http://parstoday.com/fa/middle_east-i159387 | عنوان=دادگاه رژیم بحرین، حبس ابد شیخ علی سلمان را تایید کرد | ناشر=پارس تودی | تاریخ=۰۸ بهمن ۱۳۹۷}}</ref> دادگاه تجدید نظر بحرین نیز در جلسه روز دوشنبه ۲۸ ژانویه ۲۰۱۹ این حکم را تایید نمود.<ref name="پارس">{{یادکرد وب | نشانی=http://parstoday.com/fa/middle_east-i159387 | عنوان=دادگاه رژیم بحرین، حبس ابد شیخ علی سلمان را تایید کرد | ناشر=پارس تودی | تاریخ= ۹ بهمن ۱۳۹۷}}</ref>