مدیریت مرکز دایرةالمعارف بزرگ اسلامی در اردیبهشت ۱۳۹۷ بیش از ۵۰ نفر از نویسندگان، پژوهشگران، اعضای شورای عالی علمی و همکاران دایرةالمعارف را اخراج کرد که برخی از این افراد سابقۀ ۳۰ سال همکاری با مرکز را داشتند. پس از این اخراج‌ها شایعاتی مبنی بر احتمال تعطیلی مرکز منتشر شد. گفته می‌شود که این افراد از منتقدان [[سید محمدکاظم موسوی بجنوردی]] مدیر مرکز بوده‌اند و پس از جلسه‌ای که با وی داشته‌اند و در روز ۲ اردیبهشت (سالروز انقلاب فرهنگی) اخراج شده‌اند.<ref name="دایرةالمعارف ۳">[https://chamedanmag.ir/زمزمه‌های-تعطیلی-دائره-المعارف-بزرگ-ا/ مجلۀ چمدان: ''زمزمه‌های تعطیلی دائرةالمعارف بزرگ اسلامی: قطع همکاری با ۵۰ نفر از کارکنان''، نوشته‌شده در ۱ اردیبهشت ۱۳۹۷؛] بازدید در ۲۶ آوریل ۲۰۱۸.</ref> [[سید محمدصادق سجادی]] یکی از اعضای شورای عالی علمی مرکز بوده که به دلیل انتقاداتی که به مرکز دایرةالمعارف بزرگ اسلامی و مدیریت آن وارد کرده‌است، طی حکمی به تاریخ ۲ اردیبهشت ۱۳۹۷، از سوی مدیریت مرکز دایرةالمعارف بزرگ اسلامی [[سید محمدکاظم موسوی بجنوردی]] از این مرکز و شورای عالی علمی آن اخراج شده‌است.<ref name="دایرةالمعارف ۲">[https://media.mehrnews.com/d/2018/04/24/4/2766638.jpg مرکز دایرةالمعارف بزرگ اسلامی: ''حکم اخراج صادق سجادی''؛] بازدید در ۲۶ آوریل ۲۰۱۸.</ref> سیدمحمدصادق سجادی در گفت‌وگو با [[خبرگزاری مهر]] گفته‌است که دیگر نمی‌توانسته با این مرکز همکاری کند و لذا استعفا کرده‌است.<ref name="مهر ۱">[https://www.mehrnews.com/news/4279800/مرکز-دایره-المعارف-بزرگ-اسلامی-سجادی-استعفا-نداده-اخراج-شده خبرگزاری مهر: ''مرکز دایرةالمعارف بزرگ اسلامی: سجادی استعفا نداده، اخراج شده است''، نوشته‌شده در ۴ اردیبهشت ۱۳۹۷؛] بازدید در ۲۶ آوریل ۲۰۱۸.</ref>
