مدرسه عالی شهید مطهری از ابتدای انقلاب اسلامی محل پرورش بسیاری از کارگزاران جمهوری اسلامی بوده و بسیاری از فرزندان مقامات ارشد جمهوری اسلامی در این محل تحصیل نموده‌اند
از فارغ التحصیلان این مجموعه می‌توان از افراد زیر نام برد: سید مسعود خامنه ای (فرزند سید علی خامنه ای رهبر ایران) مرتضی اشراقی (نوه روح‌الله خمینی رهبر پیشین ایران) ابراهیم رییسی (معاون اول قوه قضاییه) محسن اسماعیلی (عضو حقوقدان سابق شورای نگهبان و عضو مجلس خبرگان رهبری) سید احمد موسوی (سفیر ایران در سوریه) صادق کنجیگنجی (رایزن فرهنگی ایران در پاکستان) علی خلفی (مشاور و رئیس حوزه ریاست قوه قضاییه) علی دارابی-(معاون سیمای صدا و سیمای جمهوری اسلامی) یدالله حبیبی (معاون عقیدتی و سیاسی وزارت دفاع) محمد روشن (معاون وزارت دفاع) سید مهدی خاموشی (رئیس سابق سازمان تبلیغات اسلامی و رئیس فعلی اوقاف) محمود بریمانی (مدیر کل سازمان‌های تخصصی و اقتصادی وزارت امور خارجه) مجتبی فردوسی پور (مدیر کل اداره دوم خاورمیانه (خلیج فارس) وزارت امور خارجه) علی مژدهی پور (رئیس سازمان تعزیرات حکومتی) محمد بهرامی (عضو مجلس خبرگان رهبری) محمد جواد حاج علی اکبری (معاون سابق رئیس‌جمهور و رئیس سازمان ملی جوانان و رئیس فعلی شورای سیاست گذاری ائمه جمعه) احمد مؤمنی راد (مشاور ارشد وزیر و مدیر کل حوزه وزارت در وزارت علوم) محمد ابراهیم محمدی (معاون وزارت نفت قاسم شعبانی - از وکلای بین الملی جمهوری اسلامی) محمد مهدی اسماعیلی -(معاون سیاسی و امنیتی استانداری اصفهان). سپهر خلجی (مدیرکل روابط عمومی دفتر رهبری) حسن رضازاده (رایزن فرهنگی ایران در روسیه) اقایان ملا حسینی، نفر، بیات، محمدی، رستمی و … از دیپلمات‌های ارشد وزارت خارجه و نیز تعدادی دیگر از قضات و مدیران عالی‌رتبه و میانی حکومتی که در این محل تحصیل نموده‌اند نام برد.
در ۲۴ فروردین ۱۳۸۹، شورای عالی انقلاب فرهنگی، نام مدرسه عالی را به دانشگاه تغییر داد. این تغییر با مخالفت بسیاری از دانش‌آموختگان مدرسهٔ عالی شهید مطهری مواجه شد.{{مدرک}}
