کریم باقری فوتبال خود را با تیم [[باشگاه فوتبال تراکتورسازی تبریز|تراکتورسازی]] شروع کرد. واو اولیننخستین بار در هفته پنجم مسابقات [[لیگ آزادگان]] مقابل [[باشگاه فوتبال استقلال تهران|استقلال]] در [[ورزشگاه آزادی]] و در حالی که ۱۷ سال داشت، به میدان رفت. کریمباقری در ابتدای دوران فوتبال خود در پست دفاع بازی می‌کرد. واو در ایننخستین بازیفصل که تیمش ۲–۱ باخت، نمایش خوبی داشت.حضور در فصل اول حضورشتراکتورسازی ۱۵ بازی انجام داد و یک گل به ثمر رساند. اولین گل اوباقری حاصل یک ضربه پنالتی بود که وارد دروازه [[باشگاه فوتبال سپاهان|سپاهان]] شد. باقری در دومین فصل حضور در تراکتورسازی به تیم ملی جوانان دعوت شد.<ref name="asriran">{{یادکرد وب| عنوان = حضور پرتداوم کریم باقری در فوتبال باشگاهی | ناشر = عصر ایران| نشانی = http://www.asriran.com/fa/news/108179/حضور-پرتداوم-کريم-باقري-در-فوتبال-باشگاهي| تاریخ بازدید = ۴ اکتبر ۲۰۱۱| تاریخ = ۲۴ فروردین ۱۳۸۹}}</ref>
