پیش از تأسیس سازمان بورس و اوراق بهادار (در سال ۱۳۸۴)، «سازمان کارگزاران بورس اوراق بهادار تهران (سابق)»، همزمان، عهدهدار نظارت و عملیات بازار اوراق بهادار ایران بود؛ ولی، با تصویب [[قانون بازار اوراق بهادار جمهوری اسلامی ایران]] توسط [[مجلس شورای اسلامی]] (۱ آذر ۱۳۸۴) عملیات اجرایی بورسها به [[بورس اوراق بهادار تهران]]، [[فرابورس ایران]]، [[بورس کالای ایران]] و [[بورس انرژی ایران]] (همگی در قالب [[شرکت سهامی عام]]) و مسئولیت نظارت بر این بورسها، نهادهای مالی و اوراق بهادار به [[شورای عالی بورس و اوراق بهادار]] و سازمان بورس و اوراق بهادار واگذار شد.<ref>معرفی اجمالی بازار سرمایه ایران.</ref> ریاست سازمان بورس و اوراق بهادار از ابتدای تأسیس بر عهده [[علی صالحآبادی]] بود و در ۲۵ آذر ۱۳۹۳، [[محمد فطانتفرد]] عهدهدار این وظیفه شد.<ref>.{{یادکرد وب|نویسنده = |نشانی = http://www.farsnews.com/newstext.php?nn=13930925000906 |عنوان = محمد فطانتفرد به ریاست سازمان بورس منصوب شد+متن حکم| ناشر = فارس نیوز|تاریخ = ۲۵ آذر ۱۳۹۳ |تاریخ بازدید = ۱۶ دسامبر ۲۰۱۴}}</ref>
پس از استعفای [[محمد فطانتفرد]]، در تاریخ ۵ مرداد ۱۳۹۵، [[شاپور محمدی]] ریاست این سازمان را بر عهده گرفت<ref>.{{یادکرد وب|نویسنده = |نشانی = http://www.boursi.com/index.php?option=com_content&view=article&id=637:2016-07-26-12-54-57&catid=22:اخبار-بورسی-و-اقتصادی&Itemid=138 |عنوان = شاپور محمدی رئیس جدید بورس شد