ملاصدرا [[شیعه]] مذهب و پیرو آئین [[اثنی‌عشری|دوازده‌امامی]] بود، به [[اصول شیعه|اصول]] و [[فروع دین]] اسلام و مذهب شیعه اعتقاد داشت. همان‌طور که در فقه شیعه چهار اصل قرآن، حدیث، عقل و اجماع برای بدست آوردن احکام بکار می‌رود، ملاصدرا نیز در مباحث عقلی تلاش وافری نمود تا این وجهه از برهان جایگاه خود را در مذهب شیعه دوباره بازیابد، وی در کتاب الاسفارالاربعه جلد ۸ آورده است: "نمی شود قوانین این دین بر حق الهی (اسلام) که چون خورشید روشن و درخشان است با دانش استدلالی یقینی مخلفتمخالفت داشته باشد. نیست باد فلسفه ای که قوانینش با کتاب قرآن و سنت رسول خدا و ائمه اطهار مطابقت نداشته باشد."<ref>{{یادکرد وب|نویسنده = |نشانی = http://www.mullasadra.org/New_Site/Persian/Mullasadra/moghadameh%20mabani.htm |عنوان = مقدمه ای بر مبانی ملاصدرا| ناشر =پایگاه اطلاع‌رسانی حکمت اسلامی ملاصدرا |تاریخ = |تاریخ بازدید = ۱۱ سپتامبر ۲۰۱۸}}</ref><ref>{{یادکرد وب|نویسنده = |نشانی = http://www.mullasadra.org/New_Site/Persian/Mullasadra/az%20korsi%20ostadi.htm |عنوان = از کرسی استادی تا گوشه انزوا| ناشر =پایگاه اطلاع‌رسانی حکمت اسلامی ملاصدرا |تاریخ = |تاریخ بازدید = ۱۱ سپتامبر ۲۰۱۸}}</ref><ref>{{یادکرد وب|نویسنده = |نشانی = http://www.mullasadra.org/New_Site/Persian/Mullasadra/moghadameh%20mabani.htm |عنوان = مقدمه ای بر مبانی| ناشر =پایگاه اطلاع‌رسانی حکمت اسلامی ملاصدرا |تاریخ = |تاریخ بازدید = ۱۱ سپتامبر ۲۰۱۸}}</ref>
