در سال ۱۳۷۷ خورشیدی فاش شد که تعدادی از فعالین سیاسی ایران به وسیله اعضای [[وزارت اطلاعات جمهوری اسلامی ایران]] به قتل رسیدهاند اما وزارت اطلاعات طی اطلاعیهای عوامل قتلها را خودسر نامید.
== حق فعالیت گروهها ==
مقامات جمهوری اسلامی اصرار دارند کارگران ایرانی مطالبات صنفی خود را از طریق «خانه کارگر» دنبال کنند، ولی کارگران اعتقاد دارند این تشکیلات جانبدارانه عمل میکند و در دفاع از حقوقشان بیشتر سیاست رسمی را به اجرا میگذارد. کارگران ایران خود اتحادیههای مستقل در صنایع مختلف سراسر کشور ایجاد کردهاند که به علت نارضایتی کارگران، از وضعیت نامناسب اقتصادی کشور با استقبال شایان توجهی مواجه شدهاست.
=== سندیکای کارگران اتوبوسرانی ===
پس از آنکه ده تن از اعضای [[سندیکای کارگران شرکت واحد اتوبوسرانی تهران و حومه]] روز ۱ دی ۱۳۸۴ به حکم دادستان تهران بازداشت شدند، در شامگاه شنبه ۳ دی ۱۳۸۴، بیش از ۱۲۰۰ راننده مناطق ۶، ۱۰ و ۸ شهر تهران، دست به اعتراض زدند و کارکنان شیفت روز بعد نیز به آنها ملحق شدند. شماری از کارکنان فنی نیز سرکار نرفتند.
پس از این حادثه در ۸ بهمن ۱۳۸۴ مأموران ضد شورش جمهوری اسلامی ایران با دستگیری شماری از اعضا سندیکای شرکت واحد اتوبوسرانی تهران سعی کردهاند مانع از اعتصاب آنها شوند. این افراد خواستار آزادی [[منصور اسانلو]]، رئیس هیئت مدیره سندیکای شرکت واحد اتوبوسرانی تهران بودند. اسانلو در پی اعتراضهای صنفی بازداشت شد و بیش از هفت ماه در زندان به سر برد.<ref>[http://www.bbc.co.uk/persian/business/story/2005/12/051225_ra-iran-strike.shtml اعتصاب صدها نفر از کارکنان اتوبوسرانی در تهران] وبگاه بیبیسی فارسی</ref><ref>[http://www.bbc.co.uk/persian/iran/story/2006/01/060128_ra-busdrivers-strike.shtml برخورد پلیس ضد شورش با کارکنان معترض شرکت واحد تهران] وبگاه بیبیسی فارسی</ref><ref>[http://www.bbc.co.uk/persian/iran/story/2007/06/070616_mv-osanloo.shtml اسانلو: سندیکا نیازی به تأیید نهادهای دولتی ندارد] وبگاه بیبیسی فارسی</ref>
=== معلمان ===
در[[اسفند]] ۱۳۸۵، معلمین تظاهراتی در شهرهای مختلف ایران را برای برابری حقوق و مزایا با سایر مشاغل دولتی در «نظام هماهنگ پرداخت» سازماندهی کردند. در ۱۲ اسفند ۱۳۸۵، معلمین در تهران تجمع مسالمتآمیزی دراعتراض به بیتوجهی حکومت جمهوری اسلامی به حقوق و مزایای معلمین در مقابل مجلس براه انداختند. این تظاهرات به مدت دوهفته ادامه یافت تا آنکه در ۱۳ مارس پلیس ضد شورش و نیروهای امنیتی صدها تن از معلمین معترض را دستگیر کردند. این دستگیریها تا نیمه آوریل ادامه یافت.<ref>[http://hrw.org/reports/2008/iran0108/iran0108prweb.pdf ایران سرکوب فعالان مستقل را وسیعتر میکند] وبگاه دیدهبان حقوق بشر</ref>
=== فعالان محیط زیست ===
قوه قضائیه حکومت ایران روز ۲۹ مهر ۱۳۹۷ (۲۱ اکتبر ۲۰۱۸) پنج تن از فعالان [[محیط زیست]] بنامهای طاهر قدیریان، هومن جوکار، سپیده کاشانی، مراد طاهباز و نیلوفر بیاتی را مفسد فی الارض اعلام کرد. این افراد به همراه کاووس سید امامی، سام رجبی و امیرحسین خالقی در بهمن ۹۶ توسط [[سازمان اطلاعات سپاه پاسداران]] بازداشت شده و مدتها بدون طرح اتهام در سلولهای انفرادی محبوس بودند. محمدحسین آقاسی وکیل یکی از متهمین اعلام کردهاست که این اتهام ثابت نشده و بایستی مدارک کافی ارائه شود.<ref>[https://www.dw.com/fa-ir/iran/av-45984092 "اتهام فساد فیالارض به فعالان محیطزیستی باید ثابت شود"]</ref>