باکییف در سال ۱۹۷۲ تحصیل خود را در رشتهرشتهٔ مهندسی برق به پایان رساند و در سامارای روسیه شروعآغاز به کار کرد. از سال ۱۹۷۴ تا ۱۹۷۶ را به خدمت سربازی گذراند. پس از بازگشت خود به قرقیزستان، در یک کارخانهکارخانهٔ پلاگین در منطقهٔ جلالآباد، از سال ۱۹۷۹ تا ۱۹۹۰ به عنوان جانشین مهندس ارشد و بعدپس از آن به عنوان مدیرکل کار میکرد. او از سال ۱۹۹۰ در [[حزب کمونیست اتحاد شوروی]] فعال بود، در ابتدا به عنوان منشی اول حزب در Kok - Yangak، سپس رئیس اتحاد جماهیر شوروی عالی شهرستان و در نهایت معاون منطقهمنطقهٔ جلالآباد. در سال ۱۹۹۵ او توسط رئیسجمهور وقت اصغر آقایف به عنوان فرماندار جلالآباد منصوب شد. در ماه آوریل سال ۱۹۹۷ به دفتر فرمانداری Tschüi منتقل شد. در ۲۱ دسامبر ۲۰۰۰ نخستوزیر قرقیزستان شد. تنها ۱۷ ماه بعد، در ۲۲ مهمهٔ ۲۰۰۲، بعدپس از اینکه در شهر جنوبی Aksy شش تظاهرکننده توسط پلیس امنیتی تیر خوردند، از سمت خود استعفا داد.