* به گفته سایت اصولگرای الف رحیمی آمر و طراح نقشه پرداخت چک ۵ میلیون تومانی به نمایندگان مجلس در ازای پس گیری استیضاح [[علی کردان]] بود که احمدی نژاد هم دستور رسیدگی و برخورد با عوامل آن را صادر کرد.<ref>[http://alef.ir/1388/content/view/53535/ رحیمی معاون اول احمدینژاد شد] الف، ۲۲ شهریور ۱۳۸۸</ref> عامل اصلی این پرونده مدیرکل امورمجلس ریاستجمهوری (زیر نظر رحیمی) بود.<ref>[http://www.etemaad.ir/Released/88-06-23/103.htm با حکم محمود احمدی نژاد به محمدرضا رحیمی مرد حاشیه ساز دولت معاون اول شد] روزنامه اعتماد، ۲۳ شهریور ۱۳۸۸</ref>
* در مورد مدرک دکترای علیرضا رحیمی شبهات زیادی وجود دارد، هیچکس نمیداند او مدرک دکترای خود را از چه دانشگاهی گرفته و با [[کردانیسم|مدرک دکترای کردان]] مقایسه میشود]]. [[علیرضا زاکانی]] در جریان جلسه استیضاح کردان و در واکنش به شکایت رحیمی از رسانههایی که درباره مدرک کردان خبر منتشر کردهبودند، مدرک رحیمی را ''قُلِ'' دوم مدرک کردان توصیف کرده بود<ref>[http://www.etemaad.ir/Released/88-06-23/103.htm با حکم محمود احمدی نژاد به محمدرضا رحیمی مرد حاشیه ساز دولت معاون اول شد] روزنامه اعتماد، ۲۳ شهریور ۱۳۸۸</ref> در شهریور ۱۳۸۸ پس از درخواست [[الیاس نادران]]، دیگر نماینده اصولگرای مجلس هشتم، برای بررسی مدرک دکترای رحیمی،این درخواست مورد موافقت هیات رئیسه مجلس قرار گرفت.<ref>[http://www.khorasannews.com/news.aspx?3_17358_16_1419.XML نادران: هیئت رئیسه مجلس صحت مدرک دکترای رحیمی را بررسی کند]روزنامه خراسان ،صفحه ۱۶، تاریخ انتشار ۱۳۸۸/۰۶/۱۶</ref> [[احمد توکلی]] رئیس مرکز پژوهشهای مجلس مدرک رحیمی را قطعا مدرکی قلابی و مشابه مدرک کردان میداند. او همچنین از دروغگویی رحیمی در جریان مدرک کردان انتقاد کرده و از احمدینژاد هم به دلیل انتخاب کسی که به گفته او ْسوابق دروغگویی و سوء استفاده از قدرت و سوء استفاده از مدرک جعلی دارد» انتقاد کردهاست.<ref>[http://www.fararu.com/vdciryap.t1azq2bcct.html توکلی: رحیمی میداند مدرکش جعلی است] فرارو، ۲۴ شهریور ۱۳۸۸</ref> محمود احمدی نژاد در مجلس با شنیدن سوال خبرنگاران درباره مدرک رحیمی رویش را به سمت دیگر برگرداند اما رحیمی که در حلقه خبرنگاران گرفتار شده بود سعی کرد با خونسردی کار مجلسیها برای بررسی صحت مدرکش را بیهوده بنامد و بپرسد مگر در مملکت هیچ مشکلی وجود ندارد که نمایندهها به دنبال اثبات جعلی بودن مدرک دکترای او هستند.<ref>[http://www.norooznews.org/news/10384.php نوروز]</ref>{{سخ}}در مورد مداراک قبلی نیز، مدرک لیسانس حقوق وی از دانشگاه تهران مورد تأیید همه است اما برخی نمایندگان مجلس در مورد مدرک مدرک کارشناسی ارشد او تردید دارندنمودند. بگفتهبه گفته هفتهنامه اصولگرای ''پنجره'': «براساس سند موجود در سازمان اسناد و کتابخانه ملی جمهوری اسلامی ایران، رحیمی مدرک فوق لیسانس خود را در رشته جامعهشناسی در سال ۱۳۷۹ از دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران مرکز دریافت کرده است؛ «بازتاب ساختارهای سیاسی، اقتصادی و اجتماعی ایران در گلستان و بوستان سعدی» عنوان پایاننامه اوست و [[غلامعباس توسلی]] از چهرههای برجسته جریان [[ملی مذهبی]] استاد راهنمای وی بوده است. <ref>[http://www.panjerehweekly.com/main/index.php?Page=definition&UID=26307 گزارشی از جنجال درباره مدرک تحصیلی آقای معاون اول(رحیمی در مسیر کردان)] هفتهنامه پنجره، ۴ مهر ۱۳۸۸</ref> او در زمان حضور در دانشگاه آزاد نامه های اداری را با عنوان دکتر امضا می نموده است.<ref>[http://alef.ir/1388/content/view/53025 الف]</ref> برخی خبرگزاری ها مدعی شدند که دکتر توسلی او را دانشجوی خوبی خوانده و مدرک دکترای او را بدون اشکال اعلام کرده است ولیکن وی ضمن تکذیب این مطلب تنها تایید کرد که هزاران دانشجو طی نیم قرن پایان نامه هایشان را به راهنمایی وی به پایان رسانده اند و رحیمی نیز یکی از آنان بوده است. <ref>[http://www.mizanpress.org/index.php?option=com_content&view=article&id=5398:2009-09-28-21-50-19&catid=5:2009-04-01-10-24-23&Itemid=66 میزان پرس]</ref>
* طرفداران احمدینژاد در اعتراض به انتخاب رحیمی به حمایت او از [[هاشمی رفسنجانی]] در [[انتخابات ریاست جمهوری ایران (۱۳۸۴)|انتخابات ریاستجمهوری سال ۱۳۸۴]] اشاره میکنند؛ وقتی که هاشمی در زمان استانداری او به کردستان سفر کرد. رحیمی کشاورزان را مجبور کرد که دهها تراکتور خود را به گونهای پارک کنند که از بالا جمله «درود بر هاشمی» را شکل بدهند و در همین سفر نیز بر دستان هاشمی رفسنجانی بوسه زده بود. این درحالیست که یکی از مهمترین دلایل موفقیت احمدینژاد مخالفتهای صریح او با هاشمی رفسنجانی است.<ref>[http://www.jahannews.com/vdca0ani.49nmm15kk4.html بوسه معاون اول احمدی نژاد بر دستان هاشمی رفسنجانی] جهاننیوز، ۲۳ شهریور ۱۳۸۸</ref>