بازی در افغانستان شروع میشود، جایی که [[سپاه تفنگداران دریایی ایالات متحده آمریکا]] به فرماندهی ژنرال شپرد در تلاش اند تا یکی از شهرهای افغانستان را از دست نیروهای جنگ طلب خارج کنند. در این قسمت سرباز یکم جوزف آلن یکی از نقشهای اصلی عملیات را بر عهده دارد. آلن جاسوس سازمان [[سیا]] است و با نام مستعار اَلکسی بورودین برای نزدیکی به ماکاروف وارد نیروهای او میشود. سروان جان «سُوپ» مکتاویش و گروهبان گری «رُوچ» سندرسون تحت گروه ۱۴۱ وارد یک منطقهٔ هوابرد در روسیه میشوند تا نمونههای گمشدهٔ سازمان اسسیاس از یک [[ماهواره]] را بازیابی کنند. در این حین آلن وارد نیروهای ماکاروف شده و به قتلعام مردم در فرودگاه بینالمللی زاکائف میپردازد. ماکاروف که از قبل به نقشهٔ آلن پی برده بود، او را میکشد و هویتش را به عنوان یک شخص آمریکایی برملا میسازد. به این ترتیب روسیه، آمریکا را مسئول این جنایت میداند و به آمریکا حملهٔ نظامی میکند. به سرباز جیمز رامیرز و تیمش در تفنگداران دریایی آمریکا به رهبری گروهبان یکم فولی مأموریت داده میشود تا از [[حومه شهر|حومهٔ شهر]] و مناطق شمال شرقی [[ویرجینیا]] در مقابل حملات روسها دفاع کنند. سپس آنها به سمت [[واشینگتن، دی.سی.]] حرکت میکنند.<ref name="MW2-ps3"/>
تیم ۱۴۱ روی پروندهٔ ردیابی ماکاروف کار میکند و متوجه میشود که بزرگترین مخالف ماکاروف یک فرد در زندان گولاگ با کد 627 (Prisoner 627) است. سروان سُوپ مک تاویش زندانی ۶۲۷ را آزاد میسازد و متوجه میشود این شخص همان [[کاپیتان پرایس]] است که گمان میکرد مرده بود. واشینگتن که مورد حمله نیروهای روس قرار گرفته است در آستانه سقوط و در حال تخلیه است و رامیرز و گروهش وظیفه پشتیبانی از عملیات تخلیه را پیدا میکنند که در آخر هلیکوپتر حامل رامیرز و گروه مورد اصابت موشک قرار میگیرد و سقوط میکند . پرایس تصمیم میگیرد به سمت هیجاک، یک [[زیردریایی هستهای]] روسی برود و یک [[موشک بالیستیک]] قارهپیما را به سمت [[واشینگتن، دی.سی.|واشینگتن]] شلیک کند وولی تصمیم میگیرد کلاهکی را در موشک قرار دهد و آن را در [[جو (هواشناسی)|اتمسفر]] منفجر کند تا پالس[[ایستگاه الکترونیکیفضایی ایجادبینالمللی]] ونابود شود ولی پالس الکترونیکی باعث شودمیشود که همهٔ وسایل الکترونیکی از کار بیفتد .برقاندکی بعد رامیرز و تمامگروهش وسایلمتوجه برقیمیشوند شهر واشینگتن بعد از [[جنگافزار هستهای|انفجار هستهای]] از کار افتاده است دست رفتهاست. رامیرزتنها وراه گروهشتمام کهکردن ازمأموریت سقوطقرار هلیکوپتر جان سالم بدر برده اند مأمور میشونددادن فشفشهٔ سبز روی پشتبام [[کاخ سفید]] است که تحت کنترل نیروهای روسی قرار گرفتهاست روشن کنند تا از حمله هوایی و با خاک یکسان کردن شهر توسط نیرو های خودی جلوگیری کنند. رامیرز و گروهش فشفشهٔ سبز را در حداقل زمان ممکن در محل موردخود نظرقرار روشن میکنندمیدهند. با روشنقرار شدنگرفتن فشفشهٔ سبز روی کاخ سفید، [[واشینگتن، دی.سی.]] حملهبهطور هواییقطعی لغواز میشودتصرف و کنترل واشنگتن دوباره به دست نیروهایروسها خودیخارج میافتدمیشود.<ref name="MW2-ps3"/>
برای شناساییتصرف محل اختفای ماکاروف، مک تاویش و پرایس به ''ایستگاه هوایی بونیارد'' در افغانستان و روچ و گوست به [[رشتهکوه قفقاز|کوههای قفقاز]] مقر فرماندهی و خانهٔ شخصی ماکاروف میروند. روچ و گوست اطلاعات ماکاروف را به دست میآورند اما ژنرال شپرد که فرماندهیبا عملیاتگوست رااز بعدهقبل دارددر بهارتباط گوستبوده وبه روچاو خیانت میکند، آنگوست دوو روچ را میکشد و اطلاعات را نیز میدزدد. پرایس و مک تاویش سریعاً متوجهٔ میشوند. بعد از ردیابی محل اختفای شپرد در یک پایگاه مخفی در افغانستان، در حین عملیات نفوذی، شپرد با قایق فرار میکند و به ورودی عقب یک [[سیکورسکی اماچ-۵۳]] وارد میشود. پرایس با نارنجکانداز سلاح خود [[بالگرد|هلیکوپتر]] را مورد هدف قرار میدهد و هلیکوپتر سقوط میکند، مک تاویش به جستجوی شپرد میپردازد و پس از درگیری و با کمک پرایس او را میکشد.<ref name="MW2-ps3"/><ref name="parsehgame">{{یادکرد وب|نشانی=http://parsehgame.com/component/content/article/46-naghegame/757--call-of-duty-modern-warfare-2-.html|عنوان=نقد و بررسی بازی ندای وظیفه: جنگاوری نوین ۲|تاریخ بازدید=۲۴ تیر ۱۳۸۹|تاریخ=۷ اوت ۲۰۱۰|ناشر=وبگاه پارسهگیم|زبان=فارسی| پیوند بایگانی = http://www.webcitation.org/6CwJFb1iU | تاریخ بایگانی = ۱۵ دسامبر ۲۰۱۲}}</ref>
[[پرونده:mw2.jpg|چپ|بندانگشتی|220px|در طول بازی و طی اتفاقات مختلفی که میافتد، بازیکن به همراه تیم ویژه ۱۴۱ به جز [[روسیه]]، [[قزاقستان]] و [[افغانستان]] به [[ریودوژانیرو]]ی [[برزیل]] نیز پا میگذارد.<ref name="sims470">{{یادکرد وب|نشانی=http://sims47.ir/post/1173 |عنوان=پیش نمایش بازی ندای وظیفه: جنگاوری نوین ۲|نویسنده=|تاریخ بازدید=۲۹ اکتبر ۲۰۰۹|تاریخ=۲۹ اکتبر ۲۰۰۹|ناشر=وبگاه سیمز ۴۷ |صفحه=|زبان=فارسی| پیوند بایگانی = http://www.webcitation.org/6CwJHUd5Z | تاریخ بایگانی = ۱۵ دسامبر ۲۰۱۲}}</ref>]]