ویکی‌پدیا

تعامل پروتئین-پروتئین: تفاوت میان نسخه‌ها

نمایش تاریخچه به صورت تعاملی
→ تفاوت قدیمی‌ترتفاوت جدیدتر ←
محتوای حذف‌شده محتوای افزوده‌شده
دیداریویکی‌متن
Raamin (بحث | مشارکت‌ها)
۴۸٬۰۸۱ ویرایش‌ها
جزبدون خلاصۀ ویرایش
Afsane jafari (بحث | مشارکت‌ها)
۱۳ ویرایش‌ها
بدون خلاصۀ ویرایش
خط ۱:
{{بدون منبع۲|ماه=ژوئن|روز=۲۸|سال=۲۰۱۱|چند = ۷}}
{{ذکر منبع}}
[[Image:1dfj RNAseInhibitor-RNAse complex.jpg|thumb|The horseshoe shaped ribonuclease inhibitor (shown as wireframe) forms a protein–protein interaction with the ribonuclease protein. The contacts between the two proteins are shown as coloured patches.|250px]]
زمانی که دو یا بیش از دو [[پروتئین]] به یکدیگر متصل شوند '''تعامل پروتئین–پروتئین''' رخ می‌دهد، که غالبا عملکردهای بیولوژیکی را انجام می‌دهند. بسیاری از فرایندهای مولکولی مهم در سلول مانند تکثیر DNA توسط کمپلکسهای بزرگ مولکولی انجام می‌شوند که این کمپلکسها از تعداد زیادی پروتئین‌های سازمان دهی شده به وسیله تعامل بین پروتئینها ساخته شده‌اند.
سطر ۶ ⟵ ۴:
فعل و انفعالات پروتئین از دیدگاه زیست‌شیمی، شیمی کوانتوم، دینامیک مولکولی، انتقال سیگنال‌ها و دیگر سوخت و سازو یا ژنتیک / شبکه‌های اپی ژنتیک مورد مطالعه قرار گرفته‌اند. در واقع، تعامل بین پروتئین‌ها در هستهٔ تمام دستگاه میان‌اتمی هر سلول موجود زنده وجود دارد. این تعاملات اخیرا در فناوری نانو زیست مورد مطالعه قرار گرفته‌است.
 
تعاملات بین پروتئین‌ها برای اکثر عملکرد‌های زیست‌شناختیزیست‌ شناختی مهم هستند. به عنوان مثال، سیگنال‌های سطح خارجی یک سلول توسط تعامل پروتئینی بین مولکولهای سیگنالی به داخل سلول هدایت می‌شوند.
 
این فرایندرا انتقال سیگنال می‌نامند که نقش اساسی در بسیاری از فرایندهای بیولوژیکی و در بسیاری از بیمارها (به عنوان مثال سرطان) بازی می‌کند. پروتئین‌ها ممکن است برای مدت طولانی به شکل بخشی ازیک کمپلکس پروتئینی در تعامل باشند. یک پروتئین ممکن است در حال حمل یکی دیگر از پروتئین هاباشد. (برای مثال، از [[سیتوپلاسم]] به هسته و یا بالعکسبه وسیله ایمپورتین منافذ هسته‌ای)، و یا به طور خلاصه یک پروتئین ممکن است با یک پروتئین دیگر تعامل داشته باشد فقط برای اینکه آن را تغییر دهد (برای مثال، پروتئین کیناز یک فسفات را به پروتئین هدف اضافه می‌کند).
سطر ۱۶ ⟵ ۱۴:
تعاملات [[پروتئین]]ها آنقدر مهم هستند که روشهای بسیاری برای تشخیص آنها وجود دارد. هر روش می‌توان با توجه به حساسیت و ویژگیهایی خود دارای نقاط ضعف و قوت می‌باشد.
 
حساسیت بالا بدان معنی است که بسیاری از واکنش‌ها که در واقعیت رخ می‌دهد با screen تشخیص داده شود.ویژگی بالا نشان می‌دهد که بسیاری از فعل و انفعالات تشخیص داده شده توسط screen نیز در واقعیت رخ می‌دهد. روش‌هایی از قبیل مخمر دو هیبرید [[غربالگری ]] برای تشخیص تعامل پروتئین ‌ها می‌توانند مورد استفاده قرارگیرند. همچنین بسیاری از روشهای زیست‌فیزیکی برای بررسی ماهیت و خواص تعاملات موجود هستند. از لحاظ تئوری غالبا از [[نظریه گراف]] برای مدل کردن تعامل داده‌های بزرگ تجربی استفاده می‌کنند. [۱] <ref>Mashaghi A et al. Investigation of a protein complex network EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL B 41(1) 113–121 (2004)</ref>
 
تجسم شبکه تعامل پروتئین‌ها یک برنامه محبوب از تکنیک‌های تجسم علمی است. اگر چه نمودار تعامل پروتئین‌ها در کتاب‌های درسی شایع هستند، اما نمودار شبکه تعامل پروتئین تمام سلول‌ها به دلیل پیچیده بودن فرآیند تولیدشان زیاد استفاده نمی‌شوند.
 
یک نمونه ازتولید دستی نقشه تعاملات مولکولی در سال ۱۹۹۹ توسط کورت کوهن کشیده شد. [۲]<ref>{{cite journal | journal=Molecular Biology of the Cell| date= August 1, 1999 |volume=10|title=Molecular Interaction Map of the Mammalian Cell Cycle Control and DNA Repair Systems|author=Kurt W. Kohn| pmid=10436023|pages=2703–2734 | issue=8 | pmc=25504 }}</ref> در سال ۲۰۰۰ SchwikowskUetz و Fields مقاله‌ای درتعامل پروتئین - پروتئین در مخمرمنتشر کردند و تعامل ۱۵۴۸ پروتئین توسط آزمون‌های دو هیبریدی را تعیین کردند. آنها از یک (Sugiyama) گراف جهت دار برای تولید خودکار تصویری از شبکه استفاده کردند. [۳]<ref>{{cite journal| url=http://igtmv1.fzk.de/www/itg/uetz/publications/Schwikowski2000.pdf |format=PDF| publisher=http://www.nature.com/nbt/journal/v18/n12/full/nbt1200_1257.html | volume=18|author=Benno Schwikowski1, Peter Uetz, and Stanley Fields|journal=Nature Biotechnology| title=A network of protein−protein interactions in yeast|year=2000|pmid=11101803| pages=1257–1261| doi=10.1038/82360| issue=12}}</ref><ref>Rigaut G, Shevchenko A, Rutz B, Wilm M, Mann M, Seraphin B (1999) A generic protein purification method for protein complex characterization and proteome exploration. Nat Biotechnol. 17:1030-2. {{cite journal|pmid=10504710|year=1999|last1=Rigaut|first1=G|last2=Shevchenko|first2=A|last3=Rutz|first3=B|last4=Wilm|first4=M|last5=Mann|first5=M|last6=Séraphin|first6=B|title=A generic protein purification method for protein complex characterization and proteome exploration.|volume=17|issue=10|pages=1030–2|doi=10.1038/13732|journal=Nature biotechnology}}</ref><ref>Prieto C, De Las Rivas J (2006). APID: Agile Protein Interaction DataAnalyzer. Nucleic Acids Res. 34:W298-302. {{cite journal|pmid=16845013|year=2006|last1=Prieto|first1=C|last2=De Las Rivas|first2=J|title=APID: Agile Protein Interaction DataAnalyzer.|volume=34|issue=Web Server issue|pages=W298–302|doi=10.1093/nar/gkl128|pmc=1538863|journal=Nucleic [۴]acids [۵]research}}</ref>
 
==مجموعه ای از پایگاه داده ها ==
روش‌های شناسایی تعامل پروتئین‌ها صدها هزار تعامل را تعریف کرده‌اند. این تعاملات در پایگاههای تخصصی بیولوژیکی جمع شده‌اند که امکان مطالعه بیشتر و مونتاژتعاملات را فراهم می‌کند. اولین پایگاه داده تعامل پروتئینی DIPبود. [۶]<ref name="pmid10592249">{{cite journal |author=Xenarios I, Rice DW, Salwinski L, Baron MK, Marcotte EM, Eisenberg D |title=DIP: the database of interacting proteins |journal=Nucleic Acids Res. |volume=28 |issue=1 |pages=289–91 |year=2000 |month=January |pmid=10592249 |pmc=102387 |doi= 10.1093/nar/28.1.289|url=}}</ref> از آن زمان پایگاه داده‌های بیشتری از تعامل پروتئین‌ها ایجاد شده‌است. از جمله BioGRID، String.
 
 
== منابع ==
{{Reflist}}
{{پانویس}}
 
برگرفته از «https://fa.wikipedia.org/wiki/تعامل_پروتئین-پروتئین»