بعد از کشته شدن [[علی بن موسی رضا]] محمد تقی ۶ سال و چند ماه سن داشت و برای همین [[شیعیان]] آن وقت به [[امامت]] او شک کردن و به همین دلیل جلسههای پرسش و پاسخ برگزار کردند.<ref>{{مدرکیادکرد|نویسنده =Kate H. Winter |کتاب = The woman in the mountain: reconstructions of self and land by Adirondack| ناشر =State University of New York Press |صفحه =۲۰۷ |تاریخ = ۱۹۸۹}}</ref> او اولین امام [[شیعیان]] بود که در خردسالگی به این مقام رسید بود. به اعتقاد شیعه پدر او یعنی [[علی بن موسی رضا]] پیش از مرگ او را به عنوان امام بعد از خود معرفی کرده بود<ref>«هذا ابوجعفر قد اجلسته مجلسی و صیّرته فی مکانی؛ این ابوجعفر است که در جایگاه خود نشاندهام و در مکانم قرار دادهام.»( کافی، ج ۱، ص ۳۲۱. نشان امامت در کتف (کافی، ج ۱، ص ۳۲۱) لم یلد مولود اعظم برکة علی شیعتنا مثله (همان) هو مولی ابی جعفر (همان) ابوجعفر و حسین و خلیفتی فی اهلی من بعدی (روضة الواعظین ۲۰۳) بابی انت و امی انت لها (امامة) (اثباب الوصیة: ص ۲۱۱).