زوج کلیدهای مختلف میتوانند کاربردهای متفاوت داشته باشند. خصوصاً اینکه یک زوج کلید در الگوریتم [[امضای دیجیتالیدیجیتال]]ی (DSA) زمانیکه بر طبق خصوصیاتی پیاده سازی شدهاست، نمیتواند برای رمزگذاری و یا رمزگشایی بکار رود. بطور مشابه زوج کلید DH نمیتواند برای امضا نمودن دادهها و راستآزمایی امضا بکار رود. بعلاوه حتی یک زوج کلید بر اساس الگوریتم RSA _ که بصورت ریاضی برای تصدیق، یکپارچگی، محرمانگی و یا معاوضه کلید بکار میرود_ ممکن است به وسیلة سیاستها، احکام، یا انتخاب پیاده سازی برای استفادة تک منظوره محدود شود.