دانشگاه امام صادق یک [[دانشگاه غیرانتفاعی]] است که هزینههای خود را از سرمایهگذاریهای [[شرکت هلدینگ|هلدینگ]] جامعة الامام الصادق و مجموعه کارخانجات نساجی جامعه، [[شرکت داروسازی جابر ابن حیان|کارخانه داروسازی حیان]]، پاساژ نور و میلاد نور در تهران، کمکهای دولتی و تعدادی از بازاریهای تهران تأمین میکند.<ref>http://www.khabaronline.ir/detail/359008/Economy/political-economy</ref>
اگرچه این دانشگاه در وزارت علوم غیرانتفاعی محسوب می شود، اما هیچ گونه شهریه ای از دانشجویان خود دریافت نمی کند و تمامی امکانات رفاهی آن رایگان است. هزینه های تغذیه آن نیز به میزان سایر دانشگاه های دولتی است.
این دانشگاه طی چند سال با سطح بندی دانشجویان مقطع دکتری، از برخی از آنان که در ارزشیابی علمی رتبه "ب" یا "ج" کسب می کردند شهریه تحصیلی دریافت مینمودمیکرد.<ref>{{یادکرد وب|نام خانوادگی=SNN.IR|نام=خبرگزاری دانشجو {{!}}|کد زبان=fa-IR|وبگاه=خبرگزاری دانشجو {{!}} SNN.IR|نشانی=http://snn.ir/fa/news/624584/اخذ-شهريه-سنگين-از-دانشجويان-دكتري-به-مصلحت-نيست-استمرار-این-تفکر-مدیریتی-به-اعتبار-دانشگاه-لطمه-میزند|عنوان=اخذ شهریه سنگین از دانشجویان دکتری به مصلحت نیست/ استمرار این تفکر مدیریتی به اعتبار دانشگاه لطمه میزند|بازبینی=2018-01-26}}</ref> که به خاطر این شهریههای سنگین مورد انتقاد دانشجویان قرار گرفت که در نهایت از سال ۱۳۹۶ اقدام به پذیرش دانشجویان دکتری به صورت رایگان و تنها در گروه الف -با تعهد پژوهشی- نمود.<ref>{{یادکرد وب|وبگاه=isunews.ir|نشانی=http://isunews.ir/20207/لزوم-ايفاي-نقش-نظارتي-هيئت-امنا-دانشگاه|عنوان=خبرنامه صادق» لزوم ایفای نقش نظارتی هیئت امنا / دانشگاه امام صادق در دوره مدیریت جدید به گرانترین دانشگاه کشور تبدیل شدهاست / اخذ شهریه سنگین از دانشجویان دکتری به اذعان همه استادان به مصلحت دانشگاه نیست|بازبینی=2018-01-26}}</ref> پیش از این تغییر رویه، دانشگاه امام صادق با اخذ این شهریهها عنوان گرانترین دانشگاه ایران را به خود اختصاص داده بود.<ref>{{یادکرد وب|نام خانوادگی=News|نام=پایگاه خبری تحلیلی فردا {{!}} Farda|کد زبان=fa-IR|وبگاه=پایگاه خبری تحلیلی فردا {{!}} Farda News|نشانی=http://www.fardanews.com/fa/news/705988/دانشگاه-امام-صادق-گرانترین-دانشگاه-کشور-شد|عنوان=دانشگاه امام صادق گرانترین دانشگاه کشور شد|بازبینی=2018-01-26}}</ref>