از بدو تأسیس تاکنون ۲ نفر ریاست این بنیاد را بر عهده داشتهاند.
دکتر یوسف شاهحسینی از سال ۱۳۸۵ تا ۱۳۹۰ <ref>{{یادکرد وب|نویسنده = |نشانی = https://www.isna.ir/news/8807-01327.127627 |عنوان =آرم جايزهي بينالمللي بوعلي سينا رونمايي شد غلامرضا اعواني: حدود 40درصد40درصد از آثار بوعلیبوعلي سیناسينا چاپ نشده است | ناشر =خبرگزاری دانشجویان ایران (ایسنا) |بازبینیتاریخ =۱۸ اردیبهشت ۱۳۸۸ |تاریخ بازدید =2016-05-15}}</ref> و آیتالله غیاثالدین طهمحمدی از سال ۱۳۹۰ تا ۱۳۹۴ <ref>{{Cite web|url=http://www.farsnews.com/newstext.php?nn=13910601000971|title=رئیس بنیاد بوعلی سینا:عالم طب مدیون ابوعلی سینا است|date=|accessdate=|website=خبرگزاری فارس|publisher=|last=|first=}}</ref> ریاست این بنیاد را بر عهده داشتهاند. دور دوم ریاست آیتالله غیاثالدین طهمحمدی بر این بنیاد از تاریخ فروردین ۱۳۹۵ به مدت ۴ سال شروع شدهاست.<ref>{{یادکرد وب|نویسنده = |نشانی = http://www.irna.ir/hamedan/fa/News/83003143 |عنوان =رسانه ها برای گردآوری آثار بوعلی سینا پیش قدم شوند | ناشر =خبرگزاری ایرنا|تاریخ =۲۵ اردیبهشت ۱۳۹۷ |تاریخ بازدید =}}</ref>▼
دکتر یوسف شاهحسینی از سال ۱۳۸۵ تا ۱۳۹۰ <ref>{{یادکرد وب|کد زبان=fa|تاریخ=2009-10-10|نشانی=http://isna.ir/fa/news/8807-01327.127627/آرم-جايزه-ي-بين-المللي-بوعلي-سينا-رونمايي|عنوان=آرم جایزهٔ بینالمللی بوعلی سینا رونمایی شد
غلامرضا اعوانی:
▲ حدود 40درصد از آثار بوعلی سینا چاپ نشده است|ناشر=خبرگزاری دانشجویان ایران (ایسنا)|بازبینی=2016-05-15}}</ref> و آیتالله غیاثالدین طهمحمدی از سال ۱۳۹۰ تا ۱۳۹۴ <ref>{{Cite web|url=http://www.farsnews.com/newstext.php?nn=13910601000971|title=رئیس بنیاد بوعلی سینا:عالم طب مدیون ابوعلی سینا است|date=|accessdate=|website=خبرگزاری فارس|publisher=|last=|first=}}</ref> ریاست این بنیاد را بر عهده داشتهاند. دور دوم ریاست آیتالله غیاثالدین طهمحمدی بر این بنیاد از تاریخ فروردین ۱۳۹۵ به مدت ۴ سال شروع شدهاست.