در رتبه بندی دانشگاه های جهان QS در سال ۲۰۱۹۲۰۲۰ این دانشگاه در رده ۳۵ دنیا۳۳دنیا و دوم ژاپن قرار گرفته است.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=QS World University Rankings 2019|نشانی=https://www.topuniversities.com/university-rankings/world-university-rankings/2019|وبگاه=Top Universities|تاریخ=2018-05-29|بازبینی=2019-04-03|کد زبان=en}}</ref> در رتبه بندی برترین دانشگاه های جهان موسسه [[تایمز هایر اجوکیشن]] در سال ۲۰۱۹۲۰۲۰ دانشگاه کیوتو در رتبه ۶۵ دنیا قرار گرفته است.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=World University Rankings|نشانی=https://www.timeshighereducation.com/world-university-rankings/2019/world-ranking|وبگاه=Times Higher Education (THE)|تاریخ=2018-09-26|بازبینی=2019-04-03|کد زبان=en}}</ref>