اژدهای کومودو با نام‌های بزمجهٔبزمجه ی کومودو یا بزمجهٔبزمجه ی جزیره جزیرهٔی کومودو در ادبیات علمی شناخته می‌شود،<ref name="itis">{{یادکرد وب|نویسنده=|نشانی=http://www.itis.gov/servlet/SingleRpt/SingleRpt?search_topic=TSN&search_value=202168|عنوان=''Varanus komodoensis''|ناشر=[[سامانه متراکم داده‌های طبقه‌بندی علمی|ITIS]]|تاریخ=|تاریخ بازبینی=17 Noveber 2014|کد زبان=en| پیوند بایگانی = http://www.webcitation.org/6UuWkIx4f | تاریخ بایگانی = 18 December 2014}}</ref> هرچند که نام آخر خیلی رایج نیست. بومیان جزیرهٔ کومودو، به این جانور اورا،<ref group="و">Ora</ref> بوآیا دارات<ref group="و">buaya darat</ref> (مارمولک جزیره) یا بیاواک راکساسا<ref group="و">biawak raksasa</ref> (بزمجه غول‌پیکر) می‌گویند.<ref>{{پک|Auffenberg|1981|ک=The Behavioral Ecology of the Komodo Monitor|ص=365|زبان=en |کد زبان= en}}</ref> به اژدهای کومودو همچنین در [[زبان هندی]]، بیس‌کبرا<ref group="و">biscobra</ref> گفته می‌شود که به معنای «دو برابر زهرآگین‌تر از [[کبرا]]» است.<ref name="SanDiegoZoo">{{یادکرد وب|نویسنده=|نشانی=http://library.sandiegozoo.org/factsheets/komodo_dragon/komodo.htm#4|عنوان=Komodo Dragon, ''Varanus komodoensis''|ناشر=San Diego Zoo Global Zoo|تاریخ=|تاریخ بازبینی=12 November 2014|کد زبان=en|پیوند بایگانی=https://web.archive.org/web/20100117100540/http://library.sandiegozoo.org/factsheets/komodo_dragon/komodo.htm#4|تاریخ بایگانی=۱۷ ژانویه ۲۰۱۰|dead-url=yes}}</ref>
پس از کشف جانور توسط اروپاییان در آغاز [[سده ۲۰ (میلادی)|سده ۲۰ میلادی]]، [[پیتر اوونز]] در سال ۱۹۱۲ اقدام به گذاشتن نام علمی ''Varanus komodoensis'' بر اژدهای کومودو کرد. او در آغاز یک عکس و تکه‌ای از پوست از اژدهای کومودو به دست آورده بود، اما پس از زنده‌گیری دو اژدهای بالغ و یک نابالغ، اقدام به چاپ مقاله‌ای دربارهٔ اژدها کرد و برای نخستین بار آن را طبقه‌بندی علمی‌کرد.<ref>{{یادکرد ژورنال|نام خانوادگی= Ouwens|نام=P.A. |ژورنال=Bull. Jard. Bot. Buit. | عنوان= On a large Varanus species from the island of Komodo|سال=1912|صفحه=1-3|دوره=2|شماره=6|زبان=en}}</ref>
