کلیسای سنت فرانسیس یک کلیسا کاتولیک واقع در شهر کیتو، اکوادور می‌باشد.
ساخت و ساز این ساختمان در سال ۱۵۳۴ شروع و در سال ۱۶۰۴ به پایان رسیده است.