دانش نامه ژن و ژنوم کیوتو
این مقاله نیازمند ویکیسازی است. لطفاً با توجه به راهنمای ویرایش و شیوهنامه، محتوای آن را بهبود بخشید. |
این نوشتار نیازمند به افزودن رده تخصصی است. با توجه به ویکیپدیا:ردهبندی ردههای مورد نیاز را اضافه کنید . |
دانشنامه ژن وژنوم کیوتو یا به اختصار KEGG پایگاه دادهای مربوط به اطلاعت زیستی است که اولین بار توسط مینورور کانهیزا پروفسور در انستیتو تحقیقات شیمی در دانشگاه کیوتو در سال ۱۹۹۵ همزمان با پروژه ژنوم درست شد.[۱][۲] به منظور استفاده از تحلیل کامپیوتری برای تفسیر نتایج حاصل از پروژه ژنوم مینورور کانهیزا شروع به ساخت KEGG patheay کرد. در این پایگاه داده توسط دانش بدست آمده از آزمایشهای مختلف، نقشه و مسیرهای متابولیکی ترسیم شدهاست و همچنین تعدادی عملکرد سلول و ارگانیزمها نیز بهصورت جزئی به تصویر کشیده شدهاست. در هر نقشه شامل یکسری واکنش بین بیومولکولهای مختلف میباشد که طوری طراحی شدهاست که از این نقشه میشود اطلاعاتی راجع به ژنها و پروتئینهای دخیل در آن آگاهی یافت. در این دیتابیس میتوان مسیرهای مختلف را با هم مقایسه و و تحلیل کنیم و بهطور کلی از آنها اطلاعات سودمندی استخراج کنیم.
![]() | |
---|---|
محتوا | |
توضیح | Bioinformatics resource for deciphering the genome. |
ارگانیسمها | All |
تماس | |
مرکز پژوهش | دانشگاه کیوتو |
آزمایشگاه | Kanehisa Laboratories |
استناد ابتدایی | PubMed |
تاریخ انتشار | 1995 |
دسترسی | |
وبگاه | www |
نشانی اینترنتی خدمات وب | انتقال بازنمودی حالت see KEGG API |
ابزارها | |
وب | KEGG Mapper |
![]() |
این نوشتار نیازمند پیوند میانزبانی است. در صورت وجود، با توجه به خودآموز ترجمه، میانویکی مناسب را به مقاله بیفزایید . |
بر طبق نظر سازنده، KEGG به صورت یک «کامپیوتر ارائه دهنده» سیستمهای بیولوژیکی میباشد.[۳] این دیتابیس به صورت فعال دیاگرامها و واحدهایی متصل به هم را ایجاد میکند، که بهطور مخصوص دیاگرامهایی برای ژنها و عملکرد پروتئینهای مرتبط، واکنشهای بین مولکولهای مختلف و ایجاد یک شبکه مرتبط به هم میباشد.[۴]
منابعویرایش
- ↑ Kanehisa M, Goto S (2000). "KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes". Nucleic Acids Res. 28 (1): 27–30. doi:10.1093/nar/28.1.27. PMC 102409. PMID 10592173.
- ↑ Kanehisa M (1997). "A database for post-genome analysis". Trends Genet. 13 (9): 375–6. doi:10.1016/S0168-9525(97)01223-7. PMID 9287494.
- ↑ Kanehisa M, Goto S, Hattori M, Aoki-Kinoshita KF, Itoh M, Kawashima S, Katayama T, Araki M, Hirakawa M (2006). "From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG". Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D354–7. doi:10.1093/nar/gkj102. PMC 1347464. PMID 16381885.
- ↑ Kanehisa M, Goto S, Sato Y, Kawashima M, Furumichi M, Tanabe M (2014). "Data, information, knowledge and principle: back to metabolism in KEGG". Nucleic Acids Res. 42 (Database issue): D199–205. doi:10.1093/nar/gkt1076. PMC 3965122. PMID 24214961.