فهرست مدلهای شبیهسازی کووید-۱۹
مقاله فهرست ویکیمدیا
توجه داشته باشید که برخی از برنامههای ذکر شده فقط مدلها یا شبیهسازهای وبگاهی هستند و برخی از آنها به دادههای بیدرنگ منابع دیگر اعتماد دارند (یا از آنها استفاده میکنند).
مدلهایی با بیشترین پشتوانه علمی
ویرایشلیست فرعی شامل شبیهسازهایی است که براساس مدلهای نظری ساخته شدهاند. با توجه به تعداد بالای تحقیقات پیش از چاپ ایجاد و راهاندازی شده توسط دنیاگیری کوید-۱۹،[۱] مخصوصاً مدلهای جدیدتر فقط باید با موشکافی علمی بیشتری در نظر گرفته شوند.[۲][۳][۴]
شبیهسازیها و مدلها
ویرایش- چن و همکاران شبیهسازی بر اساس مدل Bats-Hosts-Reservoir-People (BHRP) (فقط به RP ساده شدهاست)[۵]
- کوسیم۱۹[۶] - پروفسور لهر، بر اساس مدل SEIRD
- مدل تحرک کووید-۱۹[۷] - استنفورد براساس مدل SEIR[۸]
- شبیهساز کووید-۱۹[۹] - دانشکده پزشکی هاروارد بر اساس مدل پویایی سامانه (محفظهای) معتبر[۱۰]
- کووید-۱۹ ساج[۱۱] - سیدیسی[۱۲]
- کوویدسیم[۱۳] - توسط مارک کوک یو نگ و دیگران.
- کوویدسیم - کالج امپریال لندن، امآرسی مرکز تجزیه و تحلیل بیماریهای عفونی جهانی و نیل فرگوسن و همکاران.
- کوویدسیم[۱۴] - پروژه تحقیقاتی دانشگاه علمی کاربردی مونیخ، پروفسور کوستر
- کوویدسیم[۱۵] - نوشته شده در متلب[۱۶] توسط Ng و Gui[۱۷]
- CovidSIM.eu[۱۸] - مارتین آیچنر، مارکوس شوهم با حمایت دانشگاه توبینگن و تحت حمایت وزارت آموزش و تحقیقات فدرال آلمان.[۱۹]
- کوویدسیم[۲۰] - اشنایدر و همکاران
- کوورادار[۲۱] - برای نظارت مولکولی پروتئین اسپایک کرونا[۲۲][۲۳]
- مدل دکتر غفارزادگان[۲۴][۲۵][۲۶]
- اونت هوریزون - کووید-۱۹[۲۷] - اچیو برلین براساس مدل SIR-X[۲۸]
- اِیآی تکاملی[۲۹] - «مداخلات غیر دارویی (NPIs) که اِیآی با گذشت زمان برای کشورها و مناطق مختلف ایجاد میکند، اثر پیشبینی شده آنها.»[۳۰][۳۱][۳۲]
- مدل آیاچامئی - مؤسسه سنجش و معیارهای سلامت مدل کووید
- OxCGRT[۳۳] - رهگیری پاسخ دولت آکسفورد کووید-۱۹[۳۴][۳۲]
- اسسی-کاسمو[۳۵] - مدل شبیهسازی ویروس کرونا استنفورد-SECIR[۳۶][۳۷][۳۸][۳۹] - مدلی از مرکز تحقیقات عفونت هلمهولتز
- سرمایهگذاری هوشمند منابع آزمایش آرانای ویروس برای بهسازی کاهش اثرکووید-۱۹[۴۰][۴۱]
- مجموعه اپیدمیولوژی SIAM[۴۲]
- مدل کووید یویانگ چییو
پایگاهداده ژنوم
ویرایشچندین مورد از این مدلها از پایگاه دادههای ژنوم استفاده میکنند، از جمله موارد زیر:
- بانک دادهٔ دیانای ژاپن
- بایگانی نوکلئوتید اروپا
- جییآیاسایآیدی
- نسبتدهی تبارشناختی از تبارهای شیوع جهانی نامگذاری شده
- لیست سیدیسی شامل پیشبینی و فرضیات[۴۳] - فهرست بزرگ با مدلهای مختلف و غیره
- CORSMA - کنسرسیوم اتحادیه اروپا (کووید-۱۹-شیوع پاسخ ترکیبی از سلامت الکترونیکی، سرولوژی، مدلسازی، هوش مصنوعی و تحقیقات پیادهسازی)[۴۴]
- مرکز پیشبینی کووید-۱۹[۴۵] - به عنوان مخزن مرکزی پیشبینیها و پیشگوییهای بیش از ۵۰ گروه تحقیقاتی بینالمللی عمل میکند.[۴۶][۴۷]
- نکساسنرین - پروژه منبع باز برای استفاده از توان علمی و بهداشت عمومی دادههای ژنوم پاتوژن[۴۸]
- همچنین به منابع نکساسترین سارس-کوو-۲ مراجعه کنید[۴۹]
- اسآیامآیدی[۵۰] - مدلهای شبیهسازی بیماریهای عفونی - کنسرسیوم تحقیقاتی بلژیک
- آرایامپی - کمک سریع در مدلسازی موارد دنیاگیری[۵۱] (انگلستان)
- کنسرسیوم مدلسازی UT Austin کووید-۱۹[۵۲]
نمایشگرها، مدلها یا پیشخوانهای واکسیناسیون
ویرایش- کووید-۱۹ داشبورد[۵۳] - مرکز علوم و مهندسی سیستمها (CSSE) در دانشگاه جان هاپکینز (JHU)[۵۴][۵۵]
- دیتاهاب کروناویروس جدید ۲۰۱۹ مجموعهداده[۵۶][۵۷] - مجموعهدادهٔ کووید-۱۹ بیماری کوروناویروس ۲۰۱۹ (کوید-۱۹) در سریهای زمانی موارد تأیید شده، مرگ و میر گزارش شده و بهبودی گزارش شده.
- Impfdashboard.de - مانیتور واکسیناسیون آلمان[۵۸]
- شبیهسازی کمپینواکسیناسیون-کووید ۱۹[۵۹] - نظارت بر فعالیت واکسیناسیون در آلمان توسط آزمایشگاه Zi Science Science
- پیشبینیهای مؤسسه سنجش و ارزیابی سلامت (IHME) کووید-۱۹[۶۰]
- همچنین به مدل کووید مؤسسه سنجش و ارزیابی بهداشت مراجعه کنید
مدلهایی که پشتوانه علمی کمتری دارند
ویرایشمدلهای زیر فقط برای اهداف آموزشی است.
- شبیهساز کووید-۱۹[۶۱]
- کووید۱۹: ۷ مورد برتر - فهرست برگزیده[۶۲] در مدیوم ارسال شدهاست[۶۳]
- github.com/ موضوعات: کووید-۱۹[۶۴]
- شبیهساز آیاسئیئی سیستمز کوید-۱۹[۶۵]
- nCoV2019.live[۶۶] - «اعدادی که با یک نگاه سریع به آنها نیاز دارید» توسط شیفمن / کانلون
- cov19.cc- توسط کانلون[۶۷]
- سیمول۸ - منابع شبیهسازی کووید-۱۹[۶۸]
- شبیهسازی ویروس کرونا با مدل SIR[۶۹]
- شبیهسازی گسترش ویروس[۷۰]
سایر شبیهسازیها، مدلها یا منابع داده مرتبط
ویرایش- (انجمن شیمی آمریکا) جستجوگر نشانگر زیستی کووید-۱۹ سیایاس (به انگلیسی: CAS COVID-19 BIOINDICATOR EXPLORER)[۷۱]
- ردیاب داده کووید سیدیسی[۷۲]
- شرکای جامعه مدنی در همبستگی علیه کووید-۱۹ (CSPAC): گزارش وضعیت کامل، زنده، جهانی، کووید-۱۹ برای ۲۵۱ منطقه و ۷۱ کشتی[۷۳]
- مؤسسه تحقیقات اجتماعی و اقتصادی کرنل (CISER): منابع داده کووید-۱۹[۷۴]
- مدلسازی چند فاز اولری - لاگرانژی، به عنوان مثال برای انتقال کووید-۱۹ در آسانسورها بر اساس سیافدی[۷۵]
- ویروس کرونا منبع داده دنیای ما درداده[۷۶]
- پروژه رهگیری کووید ۱۹ اقیانوس اطلس[۷۷]
- ودر (به انگلیسی: Vadere) - چارچوبی منبع باز برای شبیهسازی عابرپیاده و جمعیت[۷۸]
- داشبورد هو کروناویروس (کووید-۱۹)[۷۹]
یادگیریها و منابع دیگر
ویرایش- تخصص مدلسازی بیماریهای عفونی - ارائه شده در Coursera توسط کالج امپریال لندن
- معرفی جعبه ابزار شبیهسازی و یادگیری ماشین کووید-۱۹ برای پیشبینی گسترش کووید-۱۹ - وبلاگ یادگیری ماشین AWS
جستارهای وابسته
ویرایشمنابع
ویرایش- ↑ Brierley L. "The role of research preprints in the academic response to the COVID-19 epidemic" (به انگلیسی). doi:10.22541/au.158516578.89167184.
{{cite journal}}
: Cite journal requires|journal=
(help) - ↑ "Another 178,000 deaths? Scientists' latest virus projection is a warning". NBC News (به انگلیسی). Retrieved 2021-02-22.
- ↑ "Don't Believe the COVID-19 Models". The Atlantic (به انگلیسی). 2020-04-02. Retrieved 2021-02-22.
- ↑ "Epidemic Modeling 102: All CoVID-19 models are wrong, but some are useful". Medium (به انگلیسی). 2020-09-09. Retrieved 2021-02-22.
- ↑ Chen TM, Rui J, Wang QP, Zhao ZY, Cui JA, Yin L (February 2020). "A mathematical model for simulating the phase-based transmissibility of a novel coronavirus". Infectious Diseases of Poverty. 9 (1): 24. doi:10.1186/s40249-020-00640-3. PMC 7047374. PMID 32111262.
- ↑ CoSim19 shiny.covid-simulator.com
- ↑ COVID-19 MOBILITY MODELING covid-mobility.stanford.edu
- ↑ Chang S, Pierson E, Koh PW, Gerardin J, Redbird B, Grusky D, Leskovec J (January 2021). "Mobility network models of COVID-19 explain inequities and inform reopening". Nature. 589 (7840): 82–87. Bibcode:2021Natur.589...82C. doi:10.1038/s41586-020-2923-3. PMID 33171481.
- ↑ COVID-19 Simulator covid19sim.org
- ↑ "Policy Simulator Methodology". COVID-19 Simulator (به انگلیسی). Retrieved 2021-02-21.
- ↑ COVID-19 Surge www.cdc.gov
- ↑ CDC (2020-02-11). "Healthcare Workers". Centers for Disease Control and Prevention (به انگلیسی). Retrieved 2021-02-22.
- ↑ COVIDSIM www.markusng.com
- ↑ CovidSim www.hm.edu
- ↑ COVIDSim github.com/nkymark
- ↑ nkymark/COVIDSim, 2020-12-23, retrieved 2021-03-09
- ↑ Ng KY, Gui MM (October 2020). "COVID-19: Development of a robust mathematical model and simulation package with consideration for ageing population and time delay for control action and resusceptibility". Physica D. Nonlinear Phenomena. 411: 132599. Bibcode:2020PhyD..41132599N. doi:10.1016/j.physd.2020.132599. PMC 7282799. PMID 32536738.
- ↑ CovidSIM.eu covidsim.eu
- ↑ "CovidSIM". covidsim.eu. Retrieved 2021-03-13.
- ↑ Schneider KA, Ngwa GA, Schwehm M, Eichner L, Eichner M (November 2020). "The COVID-19 pandemic preparedness simulation tool: CovidSIM". BMC Infectious Diseases. 20 (1): 859. doi:10.1186/s12879-020-05566-7. PMC 7675392. PMID 33213360.
- ↑ CovRadar covradar.net
- ↑ الگو:Cite biorxiv
- ↑ "Molecular surveillance of SARS-CoV-2 spike protein mutations using CovRadar". News-Medical.net (به انگلیسی). 2021-02-07. Retrieved 2021-04-25.
- ↑ "Dr. Ghaffarzadegan's model - Simulate your university's covid-19 cases". forio.com. Retrieved 2 May 2021.
- ↑ Ghaffarzadegan N (2021-02-01). "Simulation-based what-if analysis for controlling the spread of Covid-19 in universities". PLOS ONE. 16 (2): e0246323. doi:10.1371/journal.pone.0246323. PMC 7850497. PMID 33524045.
- ↑ "COVID-19 simulation model creates scenarios". www.vtnews.vt.edu (به انگلیسی). Archived from the original on 6 March 2021. Retrieved 2021-02-21.
- ↑ Event Horizon - COVID-19 rocs.hu-berlin.de
- ↑ Maier BF, Brockmann D (May 2020). "Effective containment explains subexponential growth in recent confirmed COVID-19 cases in China". Science. 368 (6492): 742–746. Bibcode:2020Sci...368..742M. doi:10.1126/science.abb4557. PMC 7164388. PMID 32269067.
- ↑ Evolutionary AI evolution.ml
- ↑ "Evolutionary AI". evolution.ml. Retrieved 2021-04-26.
- ↑ A bot will complete this citation soon. Click here to jump the queue arXiv:[۱].
- ↑ ۳۲٫۰ ۳۲٫۱ "Can Computer Models Select the Best Public Health Interventions for COVID-19?". IEEE Spectrum: Technology, Engineering, and Science News (به انگلیسی). Retrieved 2021-04-26.
- ↑ OxCGRT www.bsg.ox.ac.uk
- ↑ "COVID-19 Government Response Tracker". www.bsg.ox.ac.uk (به انگلیسی). Retrieved 2021-04-26.
- ↑ SC-COSMO www.sc-cosmo.org
- ↑ Khailaie, Sahamoddin; Mitra, Tanmay; Bandyopadhyay, Arnab; Schips, Marta; Mascheroni, Pietro; Vanella, Patrizio; Lange, Berit; Binder, Sebastian; Meyer-Hermann, Michael (2020-04-07). "Estimate of the development of the epidemic reproduction number Rt from Coronavirus SARS-CoV-2 case data and implications for political measures based on prognostics". medRxiv (به انگلیسی): 2020.04.04.20053637. doi:10.1101/2020.04.04.20053637.
{{cite journal}}
:|hdl-access=
requires|hdl=
(help) - ↑ "simm / covid19 / SECIR". GitLab (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-05.
- ↑ "Report · Wiki · simm / covid19 / SECIR". GitLab (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-05.
- ↑ "Our research". Helmholtz Centre for Infection Research (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-05.
- ↑ - Smart Investment of Virus RNA Testing Resources to Enhance Covid-19 Mitigationcorona-lab.ch, accessed 28 April 2021
- ↑ Gorji H, Arnoldini M, Jenny DF, Hardt WD, Jenny P (2020-12-02). "Smart Investment of Virus RNA Testing Resources to Enhance Covid-19 Mitigation" (به انگلیسی). doi:10.1101/2020.11.30.20239566.
{{cite journal}}
: Cite journal requires|journal=
(help) - ↑ Epidemiology Collection epubs.siam.org
- ↑ CDC list of Forecast Inclusion and Assumptions www.cdc.gov
- ↑ "CORESMA". CORESMA (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-05.
- ↑ COVID-19 Forecast Hub
- ↑ "Where The Latest COVID-19 Models Think We're Headed — And Why They Disagree". FiveThirtyEight (به انگلیسی). 2020-05-01. Retrieved 2021-02-21.
- ↑ "Home - COVID 19 forecast hub". covid19forecasthub.org (به انگلیسی). Retrieved 2021-02-21.
- ↑ "Nextstrain". nextstrain.org (به انگلیسی). Retrieved 2021-04-26.
- ↑ Nextstrain SARS-CoV-2 resources nextstrain.org/sars-cov-2
- ↑ SIMID www.simid.be
- ↑ "Rapid Assistance in Modelling the Pandemic: RAMP | Royal Society". royalsociety.org (به انگلیسی). Retrieved 2021-03-09.
- ↑ UT Austin COVID-19 Modeling Consortium covid-19.tacc.utexas.edu
- ↑ COVID-19 Dashboard coronavirus.jhu.edu
- ↑ "COVID-19 Map". Johns Hopkins Coronavirus Resource Center (به انگلیسی). Retrieved 2021-04-26.
- ↑ Dong, Ensheng; Du, Hongru; Gardner, Lauren (2020-05-01). "An interactive web-based dashboard to track COVID-19 in real time". The Lancet Infectious Diseases (به انگلیسی). 20 (5): 533–534. doi:10.1016/S1473-3099(20)30120-1. ISSN 1473-3099. PMC 7159018. PMID 32087114.
- ↑ Datopian; Open Knowledge International. "Novel Coronavirus 2019". DataHub.io (به انگلیسی). Retrieved 2021-05-02.
- ↑ datasets/covid-19, Data Packaged Core Datasets at GitHub, 2021-05-02, retrieved 2021-05-02
- ↑ Gesundheit, Bundesministerium für. "Das offizielle Dashboard zur Impfkampagne der Bundesrepublik Deutschland". impfdashboard.de (به آلمانی). Retrieved 2021-06-07.
- ↑ Simulation der COVID19-Impfkampagne
- ↑ COVID-19 Projections covid19.healthdata.org
- ↑ Covid-19 Simulator www.coronasimulator.com, accessed 28 April 2021
- ↑ COVID19: Top 7 - A curated list towardsdatascience.com
- ↑ "COVID19: Top 7 online interactive simulations, curated". Medium (به انگلیسی). 2020-05-03. Retrieved 2021-02-21.
- ↑ covid-19 github.com/topics
- ↑ COVID-19 Simulator exchange.iseesystems.com
- ↑ nCoV2019.live ncov2019.live
- ↑ cov19.cc
- ↑ "COVID-19 Simulation Resources". Retrieved 2020-02-21.
- ↑ Simulating coronavirus with the SIR model بایگانیشده در ۱۹ آوریل ۲۰۲۱ توسط Wayback Machine fatiherikli.github.io
- ↑ Virus Spread Simulation c19model.com
- ↑ "CAS COVID-19 Resources". CAS (به انگلیسی). Retrieved 2021-06-02.
- ↑ COVID Data Tracker covid.cdc.gov
- ↑ "Full, live, global, COVID-19 Status Report for 251 locales & 71 Ships". civilsocietysolidarityagainstcovid19.com (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-01.
- ↑ COVID-19 Data Sources guides.library.cornell.edu
- ↑ Dbouk T, Drikakis D (January 2021). "On airborne virus transmission in elevators and confined spaces". Physics of Fluids. 33 (1): 011905. Bibcode:2021PhFl...33a1905D. doi:10.1063/5.0038180. PMC 7984422. PMID 33790526.
- ↑ Coronavirus Source Data ourworldindata.org
- ↑ COVID 19 Tracking Project covidtracking.com
- ↑ Vadere - Open Source Framework for Pedestrian and Crowd Simulation www.vadere.org
- ↑ "WHO Coronavirus (COVID-19) Dashboard". covid19.who.int (به انگلیسی). Retrieved 2021-07-01.
برای مطالعه بیشتر
ویرایشمقالات
ویرایش- Adam D (April 2020). "Special report: The simulations driving the world's response to COVID-19". Nature. 580 (7803): 316–318. Bibcode:2020Natur.580..316A. doi:10.1038/d41586-020-01003-6. PMID 32242115. S2CID 214771531.
- Alper J. "WXML 2020 covid-modeling learning guide". Department of Mathematics. Seattle, Washington: University of Washington.
- Fuller J (March 2021). "What are the COVID-19 models modeling (philosophically speaking)?". History and Philosophy of the Life Sciences. 43 (2): 47. doi:10.1007/s40656-021-00407-5. PMC 7994354. PMID 33770267.
- Roberts M, Driggs D, Selby I, Sala E, Schönlieb CB (1 June 2021). "Fighting a Pandemic with Medical Imaging and Machine Learning: Lessons Learned from COVID-19". SIAM News.
کتابها
ویرایش- Basavarajaiah D, Murthy BN (2022-04-25). COVID Transmission Modeling: An Insight into Infectious Diseases Mechanism (1 ed.). Boca Raton: Chapman and Hall/CRC. ISBN 978-1-00-320479-4. Retrieved 2022-07-23.
- Prabha S, Karthikeyan P, Kamalanand K, Selvaganesan N (7 July 2021). Computational Modelling and Imaging for SARS-CoV-2 and COVID-19 (1st ed.). CRC Press. doi:10.1201/9781003142584. ISBN 978-1-00-314258-4. S2CID 237802484.
- Azar AT, Hassanien AE, eds. (2022). Modeling, Control and Drug Development for COVID-19 Outbreak Prevention. Studies in Systems, Decision and Control. Vol. 366. Cham: Springer International Publishing. doi:10.1007/978-3-030-72834-2. ISBN 978-3-030-72833-5. S2CID 240429840. Retrieved 2022-07-23.
- Pani SK, Dash S, dos Santos WP, Bukhari SA, Flammini F, eds. (2022). Assessing COVID-19 and Other Pandemics and Epidemics using Computational Modelling and Data Analysis. Cham: Springer International Publishing. doi:10.1007/978-3-030-79753-9. ISBN 978-3-030-79752-2. S2CID 245119014.
- Martcheva, Maia (2015). An Introduction to Mathematical Epidemiology. Texts in Applied Mathematics. Vol. 61. Boston, MA: Springer US. doi:10.1007/978-1-4899-7612-3. ISBN 978-1-4899-7611-6. Retrieved 2022-09-12.
- Li, Michael Y. (2018). An Introduction to Mathematical Modeling of Infectious Diseases. Cham: Springer International Publishing. doi:10.1007/978-3-319-72122-4. ISBN 978-3-319-72121-7. Retrieved 2022-09-12.