:''این مقاله مشروح زندگی شخصی امام راحل حضرت آیت الله العظمی سید روح‌الله خمینی تا چهل سالگی است، برای مطالب جامع‌تر مقاله [[سید روح‌الله خمینی]] را ببینید.''
[[سید مصطفی خمینی (پدر امامروح‌الله خمینی)|سید مصطفی]] پدر امام خمینی، روحانی<ref name="hawze"/>.<ref name=autogenerated4>{{مدرک|منبع معتبر}}برگرفته از [http://www.imam-khomeini.com/Zendeginameh/imam%20az%20veladat%20ta%20rehlat.htm سایت امام خمینی]</ref> و مجتهد ساکن خمین بود<ref>{{یادکرد|کتاب= خمینی روح‌الله: زندگینامه امام خمینی براساس اسناد و خاطرات و خیال |نویسنده = سیدعلی قادری|ناشر =موسسه تنظیم و نشر آثار امام خمینی |چاپ= دوم|شهر= تهران|سال= ۱۳۷۹|شابک= ۹۶۴}}</ref> <ref>{{یادکرد وب| نشانی = http://noorportal.net/951/2455/16985/43818.aspx| عنوان = مـرورى بـر تقـویـم زنـدگـى حضـرت امـام خمینـى ( ره )| تاریخ بازدید = ۹ اوت ۲۰۱۱| تاریخ = سه‌شنبه ۱۲ بهمن ۱۳۸۹| سال = ۱۳۸۹| ماه = بهمن| ناشر = noorportal.net}}</ref>
حاصل ازدواج ''سید مصطفی'' با ''هاجر''، دو فرزنددختر بنام ''مولودآغا خانم'' و ''فاطمه'' و سه فرزندپسر به نام‌های ''مرتضی''، ''نورالدین'' و ''روح‌الله'' بود.<ref name="hawze"/> روح‌الله آخرین فرزند این خانواده بود. سید مصطفی در ذی‌الحجه ۱۳۲۰ (اسفند ۱۲۸۱ هجری شمسی) و در پنج‌ماهگی روح‌الله، در مسیر خمین به اراک مورد حمله قرار گرفت و با اصابت چند گلوله به ناحیه کتف و کمر شهیدکشته شد و پیکر مبارکجنازه وی به نجف منتقل و درآنجا دفن شد.<ref>به شوق چشمه (کنکاشی در زندگی و نهضت امام خمینی)، مؤسسه قدر ولایت (۱۳۸۷)، ص ۱۵.</ref>
مادر ایشان،او، بانو هاجر، نیز از پیشینه‌ی مذهبی برخوردار بود. او دختر آیت‌الله میرزا احمد<ref>{{یادکرد وب| نشانی = http://www.islamicthought.co.uk/khomeinikhomeini.html| عنوان = A Biography of Ayatollah Khomeini| تاریخ بازدید = ۹ اوت ۲۰۱۱| ناشر = Islamic Thought| زبان = انگلیسی}}</ref> و از نوادگان آیت‌الله خوانساری (صاحب زبده‌التصانیف) بود.<ref name="imam-khomeini">[http://www.imam-khomeini.com/ShowItem.aspx?id=11463&cat=11462&lang=fa امام خمینی از ولادت تا رحلت] سایت امام خمینی</ref>
[[پرونده:Pasandideh.jpg|بندانگشتی|200px|چپ|امامسید روح‌الله خمینی رحمه الله و برادرشانبرادرش سید مرتضی]]
[[پرونده:خمینی و نوه‌ها.JPG|بندانگشتی|200px|چپ|امامسید خمینیروح‌الله رحمهخمینی، الله، فرزندشان حاجفرزندش احمد آقا و نوه‌هایشاننوه‌هایش سیدحسنحسن و سیدیاسریاسر]]
