قبیله سینوکسی [[سو (قبیله سرخ‌پوست)|سو]] داکوتا تنها ساکنان منطقه کنونی شهر مینیاپولیس بودند تا اینکه در حدود سال ۱۶۸۰ جهانگردان فرانسوی به این منطقه رسیدند. با ساخت قلعه اسنسلینگ در ۱۸۱۹ توسط ارتش ایالات متحده توسعه این منطقه شدت یافت. در همان سالها دولت ایالات متحده قبیله پدواکنتون شاخه‌ای از قبیله داکوتا را مجبور به فروش زمین هایشان کرد که با اینکار زمینه مهاجرت مردم از شرق به این منطقه را فراهم نمود. مجلس قانون گذاری مینه سوتا اجازه تشکیل شهر کنونی مینیاپولیس را در سال ۱۸۵۶ به عنوان شهر در قسمت غربی رودخانه می‌سی‌سی‌پی را صادر نمود. مینیاپولیس در سال ۱۸۶۷ به عنوان شهر به ثبت رسید و از همان سال سرویس راه آهن بین میناپولیس و شیکاگو آغز شد. در سال ۱۸۷۲ قسمت شرق رودخانه شهر سنت آنتونی نیز به مینیاپولیس ملحق شد.
