وی در [[حبشه]] و در زمانی که گروهی از مسلمانان به دستور [[محمد عبدالله]] و به ریاست جعفر بن ابی‌طالب، هجرت کرده بودند، متولد شد.محمد عبدالله بعد از کشته شدن جعفر به [[اسماء بنت عمیس]] که مادر محمد بود، گفت: «غم مخور که من ولی ایشان در دنیا و آخرت هستم» و گفت: «محمد شبیه عمویم، ابوطالب است.» محمد بن جعفر طیار، در صدر اسلام در تهاجم به ایران حاضر شد و در جنگ شوشتر زخم برداشت و بر اثر همان زخم در هفت کیلومتری شهرستان دزفول، کشته و به خاک سپرده شد.
[[آرامگاه محمد بن جعفر طیار]] در دزفول به وی منتسب است. بنای این بقعه ظاهراً در عصر امیر تیمور گورکانی و پسرش شاهرخ میرزا ساخته شد و در دوره صفویه و بعد از آن چند بار تجدید بنا شد و اکنون در فهرست آثار میراث فرهنگی به ثبت رسید. اما در انتساب این بنا به وی تردید وجود دارد.
==ابهام در تایید وجود این بقعه در دزفول و علت ساخت آرامگاه==
در خصوص تأیید وجود این بقعه در شهرستان دزفول عبداللطیف خان شوشترى گفته است : در جنگ فتح شوشتر ، محمدبن جعفر طیار به سختی زخمی شده بود و در بازگشت به دزفول دعوت حق را لبیک گفته و در آنجا در خارج شهر مدفون شد .
از طرفی در کتاب جامع المَمبیرَه نوشته رجب گَر در این باره این گونه نقل شده است :
<< با توجه به اين كه در داده هاي تاريخي آمده است كه وي با ام كلثوم بعد از فوت عمر ازدواج نموده است، نمي توان پذيرفت وي در شوشتر و جنگ با ايرانيان كشته شده باشد؛ زيرا كشته شدن وي در جنگ با ايران، در دوران زندگي عمر است و ازدواج او با ام كلثوم، پس از عمر است و اين نشان دهنده آن است كه وي پس از جنگ با ايران، زنده بوده است و در ماجراي مذكور، کشته نشده است.>>
از طرف دیگر با فرض صحیح بودن وجود آرامگاه در دزفول، محمد بن جعفر از فرماندهان اعراب در حمله به ایران بوده و در کشته شدن شماری از اهالی دزفول و شوشتر نقش داشته و به همین دلیل ساختن آرامگاه برای چنین شخصی از سوی عده ای با انتقاد مواجه است .
