کاظمینی بروجردی در سال‌های ۱۳۷۴، ۱۳۷۹ و ۱۳۸۴ دستگیر و زندانی شده بود. وی بار دیگر در سال ۱۳۸۵ بازداشت و به ۱۱ سال زندان، به انضمام مصادره اموال محکوم شد. به گزارش رسانه‌ها، او در [[زندان اوین]] در شرایط بد جسمی و روحی به سر برده و از حق استفاده از دارو، مرخصی و ملاقات محروم بود. این رسانه‌ها همچنین اعلام می‌دارند که وی در زندان، بارها مورد شکنجه قرار گرفته و به بیمارستان منتقل شده‌است.احتمالا در بیمارستان هم به دلیل اینکه از دارو محروم است به جای قرص به او شکلات می دهند تا زخم هایش بهبود پیدا کند.<ref>[http://rahsanews.com/archives/36875 هجوم مأمورین به سلول کاظمینی بروجردی | رهسا نیوز<!-- عنوان تصحیح شده توسط ربات -->]</ref><ref>[http://hra-news.org/1389-01-27-05-27-21/10620-1.html هرانا؛ کاظمینی بروجردی به بیمارستان مدرس منتقل شد[http://www.rahana.org/archives/20699 ممانعت از ملاقات خانواده حسین کاظمینی بروجردی با وی | رهانا | خانه حقوق بشر ایران<!-- عنوان تصحیح شده توسط ربات -->]</ref><ref>[http://www.rahesabz.net/story/45350/ جنبش راه سبز - سوء قصد نافرجام به جان کاظمینی بروجردی در زندان اوین<!-- عنوان تصحیح شده توسط ربات -->]</ref><ref>[http://www.rahesabz.net/story/43402/ جنبش راه سبز - عدم رسیدگی پزشکی به کاظمینی بروجردی، زندانی سیاسی<!-- عنوان تصحیح شده توسط ربات -->]</ref><ref>[http://www.rahana.org/archives/44457 جلوگیری از ملاقات کاظمینی بروجردی با خانواده | خانه حقوق بشر ایران<!-- عنوان تصحیح شده توسط ربات -->]</ref><ref>[http://www.radiofarda.com/content/F10_Kazemini_Boroujerdi_Family_Letter_to_Ban_Ki_Moon_UN/2166036.html خانواده کاظمینی از دبیرکل سازمان ملل درخواست کمک کرد<!-- عنوان تصحیح شده توسط ربات -->]</ref>
او، خانواده و حامیانش، بارها با نوشتن بیانیه و نامه‌هایی به [[دبیرکل سازمان ملل متحد]]، گزارشگر ویژه حقوق بشر [[احمد شهید]] و فعالان [[حقوق بشر]] خواستار حمایت از او و آزادیش از زندان شدند.
