پس از فتح تهران، در ۱۳۲۷ سپهسالار در کابینه اول، وزیر جنگ و در رمضان همان سال، رئیسالوزرا شد. در رجب ۱۳۲۸ (تیر ۱۲۸۹) کابینه سپهدار معزول و کابینه [[حسن مستوفی|مستوفی الممالک]] سر کار آمد. با استعفای مستوفی الممالک، ناصرالملک نایب السلطنه در اسفند ۱۲۸۹ از سپهدار خواست دولت تشکیل دهد. دهم ربیعالاول ۱۳۲۹ باز کابینه تحت ریاست سپهدار تشکیل شد. به سبب اختلافاتی که بین او و [[سردار اسعد بختیاری]] بروز کرد، در تیر ۱۲۸۹ از ریاست دولت استعفا داد. نمایندگان مجلس در بیستم تیر او را همراه با سردار اسعد به جای [[دبیرالملک]] و [[علیمحمد وزیرزاده|وزیرزاده]]، دو نماینده مستعفی انتخاب کردند و این دو به مجلس رفتند<ref>{{یادکرد وب|نویسنده=|کد زبان=|تاریخ=|وبگاه=|نشانی=https://www.ical.ir/ical/fa/Content/4_artmajles1/%D8%AC%D9%84%D8%B3%D9%87-115-%D8%B5%D9%88%D8%B1%D8%AA-%D9%85%D8%B4%D8%B1%D9%88%D8%AD-%DB%8C%D9%88%D9%85-%D8%AF%D9%88%D8%B4%D9%86%D8%A8%D9%87-%DA%86%D9%87%D8%A7%D8%B1%D9%85-%D8%B1%D8%AC%D8%A8%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%B1%D8%AC%D8%A8-1328|عنوان=مذاکرات جلسه ۱۱۵ دوره دوم مجلس شورای ملی چهارم رجب ۱۳۲۸}}</ref>. در ماه امرداد کابینه [[حسن مستوفی|مستوفی الممالک]] سر کار آمد اما مستوفی الممالک پس از ورود ناصرالملک نایب السلطنه به تهران در بهمن ماه استعفا داد و در اسفند ماه ناصرالملک از سپهدار خواست دولت تشکیل دهد. او در بیستم اسفند دولت خود را به مجلس معرفی کرد. <ref>{{یادکرد وب |عنوان=مذاکرات جلسه ۲۲۲ دوره دوم مجلس شورای ملی نهم ربیع الاول ۱۳۲۹ |نشانی=https://www.ical.ir/ical/fa/Content/4_artmajles1/%D8%AC%D9%84%D8%B3%D9%87-222-%D8%B5%D9%88%D8%B1%D8%AA-%D9%85%D8%B4%D8%B1%D9%88%D8%AD-%D8%B1%D9%88%D8%B2-%D8%B4%D9%86%D8%A8%D9%87-9-%D8%B4%D9%87%D8%B1-%D8%B1%D8%A8%DB%8C%D8%B9%D8%A7%D9%84%D8%A7%D9%88%D9%84%D9%89-1329}}</ref>
پس از پیروزی بر استبداد، اختلاف جناحبندیهای درونی نیروهای مشروطه عمیقتر شد و به تشکیل دو حزب دست راستی [[اعتدالیون|اعتدال]] و حزب دمکرات انجامید. سپهسالار چون دیگر خوانین، فئودالها، اعیان و اشراف، به حزب اعتدال پیوست. رهبر فکری این حزب، [[سید محمد طباطبایی]] بود. آیتالله بهبهانی، [[میرزا علی محمد دولتآبادی]]، صدرالعلما، [[محمدعلی خان نصرت السلطان]]، [[مرتضی قلی خان نائینی]]، ذکاءالملک، معتمد خاقان، [[محمدتقی بنکدار]]، [[محمدتقی رزاز]]، از دیگر چهرههای برجسته آن بودند. [[حزب دمکرات]] که تشکیلات جناح رادیکال مشروطهخواهان بود نیز از افرادی چون: [[سید محمدرضا مساوات شیرازی|سید محمدرضا مساوات]]، [[شیخ محمد خیابانی]]، [[سید حسن تقیزاده]]، [[ابراهیم حکیمی]]، [[حیدر عمو اوغلی]]، رسول زاده، ابوالضیا، [[جلیل اردبیلی]]، [[محمد نجات]]، [[احمد قزوینی]]، [[محمدعلی خان تربیت]]، نوبری، سرتیپ دیوسالار (سالار فاتح) تشکیل شده بود. .<ref name="تاریخ تنکابن-علی اضر یوسفی نیا" /> سپهسالار از دشمنان قسم خورده جنبش جنگل بود و بارها در زمان صدارت و وزارتش، نیرو برای سرکوب آنان ارسال کرد.