=== آخرین قهرمانی در تهران ===
[[پرونده:EsteghlalFC.png|جایگزین=|بندانگشتی|نشانواره [[باشگاه فوتبال استقلال تهران|استقلال]] در سالهای ۱۳۶۹ تا ۱۳۸۱.]]فصل طولانی ۷۱–۱۳۷۰ علاوه بر مسابقات آسیایی و استانی شاهد حضور استقلال در [[جام آزادگان]] نیز بود. دوم تیرماه ۱۳۷۰ سوت نخستین دیدار [[لیگ آزادگان ۷۱–۱۳۷۰|جام آزادگان ۱۳۷۰]] به صدا درآمد. در فاصلهٔ برگزاری لیگ قدس تا شروع لیگ تازه، سربازهای ایرانی که در جنگ با عراق اسیر شده بودند به میهن بازگشتند و لیگ نوین فوتبال ایران به افتخار آن سربازها لیگ آزادگان نام گرفت. در پایان این لیگ ۱۲ تیمی، استقلال با ۳۲ امتیاز، پس از پاس ۳۴ امتیازی (بردها ۲ امتیاز داشتند) در ردهٔ دوم جدول قرار گرفت.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=Magiran {{!}} روزنامه شرق (1390/08/05): سبزقباها دوباره زنده شدند|نشانی=https://www.magiran.com/article/2386526|وبگاه=www.magiran.com|بازبینی=2020-08-06}}</ref> برگزاری اصلاً با نظم و ترتیب همراه نبود و به عنوان نمونه استقلال پیش از برگزاری بازی رفت با [[باشگاه فوتبال نساجی مازندران|نساجی مازندران]] هر دو بازی رفت و برگشت با تراکتورسازی تبریز را برگزار کرده بود. استقلال بازیهای این فصل را بسیار خوب شروع کردکرد، اما بادر ادامه بازیهابازیها، در چند بازی پیاپی دور برگشت تیمبرگشت، بدون پیروزی زمین مسابقه را ترک کرد و در نهایت به مقام دومی رسید.<ref>{{یادکرد کتاب|عنوان=تاریخچه کامل باشگاه از دوچرخه سواران و تاج تا استقلال|نام خانوادگی=احمدی|نام=علیاکبر|ناشر=انتشارات پایگان|سال=۱۳۸۸|شابک=۹۷۸-۶۰۰-۵۰۹۶-۵۷-۶|مکان=تهران|صفحه=۵۸۳}}</ref>
از اتفاقات دیگر این فصلفصل، پیروزی استقلال در هر دو بازی رفت و برگشت لیگ برابر پرسپولیس بود.<ref>{{یادکرد کتاب|عنوان=تاریخچه کامل باشگاه از دوچرخه سواران و تاج تا استقلال|نام خانوادگی=احمدی|نام=علیاکبر|ناشر=انتشارات پایگان|سال=۱۳۸۸|شابک=۹۷۸-۶۰۰-۵۰۹۶-۵۷-۶|مکان=تهران|صفحه=۵۷۹}}</ref> در بازی رفت که در اسفند ۱۳۷۰ برگزار شد استقلال در پانزده دقیقه نخست دو گل زد اما در ادامه به اداره بازی پرداخت و بازی با همین نتیجه خاتمه یافت. [[مرتضی فنونیزاده]] مدافع پرسپولیس در آن بازی بعدها در مصاحبههای تلویزیونی در مورد این بازی گفت که علی پروین، مربی آن زمان پرسپولیس که همزمان مربیگری تیم ملی را نیز بر عهده داشت، از بازیکنان استقلال خواسته بود بیشتر از آن گل نزنند.<ref>{{یادکرد وب|نشانی=https://www.yjc.ir/fa/news/5525175/%D9%BE%DB%8C%D8%BA%D8%A7%D9%85-%D9%BE%D8%B1%D9%88%DB%8C%D9%86-%D8%A8%D9%87-%D8%A7%D8%B3%D8%AA%D9%82%D9%84%D8%A7%D9%84%DB%8C-%D9%87%D8%A7%D8%AF%DB%8C%DA%AF%D8%B1-%D8%A8%D9%87-%D9%BE%D8%B1%D8%B3%D9%BE%D9%88%D9%84%DB%8C%D8%B3-%DA%AF%D9%84-%D9%86%D8%B2%D9%86%DB%8C%D8%AF|وبگاه=www.yjc.ir|بازبینی=2020-03-29|نویسنده=|کد زبان=|تاریخ=|عنوان=پیغام پروین به استقلالی ها؛دیگر به پرسپولیس گل نزنید}}</ref>
=== پنجمی در لیگ آزادگان ===
[[باشگاه فوتبال استقلال تهران در فصل ۱۳۷۱|در فصل ۱۳۷۱ استقلال]] در دومین دورهٔ لیگ آزادگان شرکت کرد. پیش از آغاز این فصل و در تیر ۱۳۷۱ منصور پورحیدریپورحیدری، که در آن زمان بیش از سه سال بود مربیگری استقلال را بر عهده داشتداشت، تیم را ترک کرد و مدتی جدا از فوتبال جدا بود. [[بیژن ذوالفقارنسب]] بعد از پورحیدری پست مربیگری استقلال را بر عهده گرفت. از بین بازیکنانی که یک سال قبل در تابستان ۱۳۷۰ با استقلال قهرمان آسیا شده بودند نیز مختاریفر، چنگیز، نامجو مطلق و احدی تیم را به دلایل مختلف ترک کردند.<ref name="بازیکنان" />
جام آزادگان از مرداد ۱۳۷۱ با ۱۶ تیم در دو گروه ۸ تیمی برگزار شد. برنامهٔ بازیها به این ترتیب بود که در پایان مسابقات گروهی دو تیم اول هر گروه به نیمه پایانی راه یابند و برندهٔ بازیهای نیمه پایانی، در فینال سرنوشت قهرمان بازیها را مشخص کنند.<ref name="ادوارآزادگان">{{یادکرد وب
}}</ref> اما بر اساس قوانین فدراسیون فوتبال ایران در آن هنگام، تیمهای حاضر در لیگ آزادگان سال بعد، بدون در نظر گرفتن رتبهٔ تیمها در لیگ سال قبل و از راه مسابقات استانی مشخص میشدند. بر اساس سهمیهبندی فدراسیون فوتبال، استان تهران در دورهٔ سوم جام آزادگان، همچون دورهٔ دوم، تنها ۴ سهمیه داشت.<ref name=":4">{{یادکرد وب|نشانی=http://90tv.ir/news/118569/نوستالژی-یادی-از-استقلال-اوایل-دهه-70-استقلال-چطور-به-دسته-سوم-سقوط-کرد؟|عنوان=نوستالژی؛ یادی از استقلال اوایل دهه ۱۳۷۰|تاریخ بازدید=|نویسنده=|تاریخ=۱۱ تیر ۱۳۹۴|ناشر=وبگاه برنامهٔ نود|زبان=|نشانی بایگانی=https://www.webcitation.org/71MuGDK5V?url=http://90tv.ir/news/118569/%D9%86%D9%88%D8%B3%D8%AA%D8%A7%D9%84%DA%98%DB%8C-%DB%8C%D8%A7%D8%AF%DB%8C-%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D8%B3%D8%AA%D9%82%D9%84%D8%A7%D9%84-%D8%A7%D9%88%D8%A7%DB%8C%D9%84-%D8%AF%D9%87%D9%87-70-%D8%A7%D8%B3%D8%AA%D9%82%D9%84%D8%A7%D9%84-%25D|تاریخ بایگانی=2 اوت 2018}}</ref>
فدراسیون بلافاصله پس از پایان دومین دورهٔ لیگ آزادگان، در دی و بهمن ۱۳۷۱ تورنمنت [[سوپر جام تهران ۱۳۷۱|سوپر جام باشگاههای تهران]] را برگزار کرد تا ۴ سهمیهٔ تهران در لیگ آزادگان سال آینده شناخته شوند. ۸ باشگاه برتر این شهر، استقلال، پرسپولیس، پاس و کشاورز از لیگ آزادگان به همراه سایپا، بانک تجارت، پورا و گسترش که چهار تیم برتر جام باشگاههای تهران ۱۳۷۱ بودند، در این تورنمنت به میدان رفتند. در میانه برگزاری این بازیهابازیها، گفته شد که تیمهای اول و دوم لیگ آزادگان، پاس و پرسپولیس، بهطور خودکار در لیگ سال بعد حاضر خواهند بود؛ بنابراین تورنمنت ۸ جانبهٔ تهران به رقابت ۶ باشگاه دیگر برای کسب دو سهمیهٔ باقیمانده بدل شد. استقلال با ۵ تساوی و ۲ شکست در ۷ دیدار خود، در این تورنمنت موفقیتی کسب نکرد و از راهیابی به لیگ آزادگان سال آینده بازماند.<ref name=":4" />
در ۱۳۷۱ سهمیهبندی تیمها توسط فدراسیون فوتبال تنها به لیگ آزادگان ختم نشد. بر اساس طرح ابتکاری فدراسیون، باشگاههای تهران حق حضور در دستهٔ دوم فوتبال ایران را هم نداشتند؛ بنابراین ۴ باشگاه استقلال، پورا، بانک تجارت و گسترش که از لیگ آزادگان کنار گذاشته شده بودند، باید از میان جام باشگاههای تهران و مسابقات انتخابی موسوم به لیگ ۳ یکی را انتخاب میکردند. بانک تجارت به مسابقات جام باشگاههای تهران بازگشت و سه تیم دیگر به لیگ ۳ مهاجرت کردند. به این ترتیب استقلال که در ردهبندی لیگ شانزده تیمی آزادگان سال ۱۳۷۱ (مجموع دو گروه) در ردهٔ پنجم جدول قرار گرفته بود، ناگزیر شد تا سال بعد را در مسابقات انتخابی سپری کند.<ref name="تاریخچه۱۳۷۱" /><ref>{{یادکرد وب
| نشانی = http://sharghnewspaper.ir/Pdf/90-08-26/8.pdf
| عنوان = تاریخچه لیگ (۱۳)
=== بازگشت بازیکنان قدیمی ===
[[پرونده:Ali Jabbari in Andrea Stramaccioni Press Conferences, 20 June 2019 (cropped).jpg|بندانگشتی|[[علی جباری]]، سرپرست [[باشگاه فوتبال استقلال تهران|استقلال]] در [[باشگاه فوتبال استقلال تهران در فصل ۱۳۷۲|فصل ۱۳۷۲]].]]
[[باشگاه فوتبال استقلال تهران در فصل ۱۳۷۲|در فصل ۱۳۷۲]] با بازیهای [[جام حذفی فوتبال ایران ۱۳۷۲|جام حذفی ۱۳۷۲]] از اردیبهشت شروع شد. استقلال در این فصل دستخوش دگرگونی شد؛ [[علی جباری]] پس از سالها به استقلال بازگشت و سرپرستی تیم را بر عهده گرفت. جباری همچنین در ۲ بازی نخست این فصل در جام حذفی موقتاً به عنوان مربی استقلال نیز کار کرد. در اردیبهشت ۱۳۷۲ز [[یوگنی سکوموروخوف]] به عنوان مربی استقلال منصوب شد شد. این اولین بار بعد از انقلاب ۱۳۵۷ و ۱۵ سال بعد از [[ولادمیر جکیچ]] بود که یک خارجی مربیگری استقلال را بر عهده میگرفت.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=تمام مربیان خارجی استقلال از رایکوف تا شفر|نشانی=https://etemadonline.com/content/167591/%D8%AA%D9%85%D8%A7%D9%85-%D9%85%D8%B1%D8%A8%DB%8C%D8%A7%D9%86-%D8%AE%D8%A7%D8%B1%D8%AC%DB%8C-%D8%A7%D8%B3%D8%AA%D9%82%D9%84%D8%A7%D9%84-%D8%A7%D8%B2-%D8%B1%D8%A7%DB%8C%DA%A9%D9%88%D9%81-%D8%AA%D8%A7-%D8%B4%D9%81%D8%B1|وبگاه=اعتمادآنلاین|بازبینی=2020-11-22|کد زبان=fa}}</ref>
در فصل ۱۳۷۲ استقلال با مشکلات مالی شدیدی نیز دستبهگریبان بود و از نظر مالی و اقتصادی در یکی از سختترین سالهای تاریخ خود به سر میبرد. به گفتهٔ علی جباری باشگاه برای پرداخت ۱۵ هزار تومان در ازای ۳۰ پرس غذا برای بازیکنان خود ناتوان بود و به رستورانهای دیگر میرفتند تا بهای ارزانتری را بپردازند. قرارداد بازیکنان استقلال در آن فصل ۳ میلیون تومان پیشپرداخت و ماهیانه ۱۸ هزار تومان بود که البته تنها شامل بازیکنان ملیپوش میشد و سایرین دستمزد کمتری میگرفتند.<ref name="جباری" />
از تیم استقلال که دو دوره پیاپی به عنوانهای قهرمانی و نایب قهرمانی در آسیا رسیده بود، چهرههایی چون [[حمید بابازاده]]، [[شاهین بیانی]]، [[عباس سرخاب]]، [[عبدالصمد مرفاوی]] و [[امیر قلعهنویی]] همچنان در ترکیب حضور داشتند اما بسیاری از بازیکنان استقلال همچون مختاریفر، بیانی، مرفاوی، عابدزاده، احدی، فنونیزاده و فلاحتزاده تیم را ترک کردند.. [[جعفر مختاریفر]] و [[جواد زرینچه]] هم پس از مدتی دوری به خانه بازگشتند و جوانانی چون [[محمود فکری]]، [[کورش تشتزر]] و [[محمدرضا مهرانپور]] نیز به آبیها پیوستند.<ref name="بازیکنان" />
تیم استقلال در لیگ ۳ جام آزادگان کار دشواری را پیش رو نداشت: مسابقات مراحل مقدماتی از خرداد ۱۳۷۲ آغاز شدند و دیدارهای مراحل نیمهنهایی و فینال در دی همان سال برگزار شدند. استقلال با پشت سر گذاشتن همهٔ حریفان به عنوان تیم اول مسابقات انتخابی برگزیده شد.<ref>{{یادکرد کتاب|عنوان=تاریخچه کامل باشگاه از دوچرخه سواران و تاج تا استقلال|نام خانوادگی=احمدی|نام=علیاکبر|ناشر=انتشارات پایگان|سال=۱۳۸۸|شابک=۹۷۸-۶۰۰-۵۰۹۶-۵۷-۶|مکان=تهران|صفحات=۶۰۱}}</ref> در جام حذفی نیز استقلال تا مرحله یک چهارم نهایی پیش رفت اما در این مرحله با شکست در مجموع دو بازی رفت و برگشت برابر [[باشگاه فوتبال جنوب اهواز|جنوب اهواز]]، نائب قهرمان همان سال، از دور مسابقات کنار رفت.<ref>{{یادکرد کتاب|عنوان=تاریخچه کامل باشگاه از دوچرخه سواران و تاج تا استقلال|نام خانوادگی=احمدی|نام=علیاکبر|ناشر=انتشارات پایگان|سال=۱۳۸۸|شابک=۹۷۸-۶۰۰-۵۰۹۶-۵۷-۶|مکان=تهران|صفحات=۶۰۲}}</ref>
=== بازگشت به کورس قهرمانی ===
[[پرونده:Esteghlal FC in 1373.jpg|بندانگشتی|[[باشگاه فوتبال استقلال تهران در فصل ۱۳۷۳|استقلال در فصل ۱۳۷۳]] با وجود آغاز ضعیف در نهایت با پیروزی در [[شهرآورد سی و نهم تهران|شهرآورد تهران]] پای به [[فینال جام آزادگان ۱۳۷۳|فینال لیگ]] گذاشت اما نتوانست عنوان قهرمانی را از آن خود کند.]]
چهارمین دورهٔ لیگ آزادگان از خرداد تا دی ۱۳۷۳ با حضور ۲۴ تیم در دو گروه ۱۲ تیمی برگزار شد. استقلال که در [[لیگ آزادگان ۱۳۷۲|دورهٔ گذشتهٔ لیگ]] حضور نداشت، بلافاصله پس از بازگشت به لیگ آزادگان تا [[فینال جام آزادگان ۱۳۷۳|فینال بازیها]] پیش رفت،رفت. در این فصل آبیها در مجموع دو بازی رفت و برگشت در نیمهنهایی لیگ آزادگان پرسپولیس را از پیش رو برداشتند. [[شهرآورد سی و نهم تهران|دیدار نخست]] که در روز ۳۰ دی ۱۳۷۳ برگزار شد، یکی از جنجالبرانگیزترین شهرآوردهای تهران بودهاست. استقلال در این بازی تا دقیقه ۸۰ با دو گل از حریف عقب بود اما طی ۶ دقیقه با گلهای [[صادق ورمزیار]] و [[ادموند اختر]] موفق شد تا بازی را برابر کند. پس از گل تساوی، امیر قلعهنویی از استقلال و [[مجتبی محرمی]] از پرسپولیس با یکدیگریکدیگر درگیر شدند و در ادامه تماشاگران به زمین چمن هجوم آوردند. بازی ناتمام رها شد و فدراسیون فوتبال پس از بازبینی مسابقه، استقلال را ۳−۰ برنده اعلام کرد. شماری از بازیکنان دو تیم با محرومیتهای بلندمدت روبهرو شدند و تماشاگران تهرانی نیز از دیدن بازی برگشت دو تیم محروم شدند.<ref>{{یادکرد وب|نشانی=https://www.tabnak.ir/fa/news/206709/%D9%85%D8%B1%D9%88%D8%B1%DB%8C-%D8%A8%D8%B1-%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%88%D9%85%DB%8C%D8%AA-%D9%87%D8%A7%DB%8C-%D9%81%D9%88%D8%AA%D8%A8%D8%A7%D9%84%DB%8C-%D8%AF%D8%B1-%D8%AA%D8%A7%D8%B1%DB%8C%D8%AE-%D9%81%D9%88%D8%AA%D8%A8%D8%A7%D9%84-%D8%A7%DB%8C%D8%B1%D8%A7%D9%86|وبگاه=www.tabnak.ir|بازبینی=2020-11-20|نویسنده=|کد زبان=|تاریخ=|عنوان=مروری بر محرومیت های فوتبالی در تاریخ فوتبال ایران}}</ref> بازی برگشت در شهر [[بندرعباس]] برگزار گردید که بدون حادثه و رد و بدل شدن گل به پایان رسید.<ref>{{یادکرد وب
| نشانی = http://www.varzesh3.com/news.do?itemid=53942
| عنوان = سه دعوای مشهور داربی
| نشانی بایگانی = https://www.webcitation.org/6EqhWDK2Q?url=http://www.varzesh3.com/news.do?itemid=53942
| تاریخ بایگانی = 3 مارس 2013
}}</ref> استقلال در حالی که بهواسطهٔ محرومیتها قلعهنویی، ورمزیار، فکری و غفوریهای اصل<ref>{{یادکرد وب|نشانی=http://www.goal.com/iran/news/1825/ایران/2011/11/27/2776578/گزارش-ویژه-گل-مروری-بر-محرومیت-ها|عنوان=مروری بر تاریخ محرومیتهای فوتبالی در ایران|تاریخ بازدید=|نویسنده=|تاریخ=۲۷ نوامبر ۲۰۱۱|ناشر=وبگاه گل|زبان=|نشانی بایگانی=https://www.webcitation.org/6Eqk6u6MF?url=http://www.goal.com/iran/news/1825/%D8%A7%DB%8C%D8%B1%D8%A7%D9%86/2011/11/27/2776578/%DA%AF%D8%B2%D8%A7%D8%B1%D8%B4-%D9%88%DB%8C%DA%98%D9%87-%DA%AF%D9%84-%D9%85%D8%B1%D9%88%D8%B1%DB%8C-%D8%A8%D8%B1-%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%88%D9%85%DB%8C%D8%AA-%D9%87%D8%A7|تاریخ بایگانی=3 مارس 2013}}</ref> را در اختیار نداشت، پا به فینال مسابقات گذاشت و در پایان به نایب قهرمانی رسید.<ref name="ادوارآزادگان" /> حریف استقلال در فینال سایپا بود که با یک گل بازی پیروز شد.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=Www.ParsSport.Ir|نشانی=https://web.archive.org/web/20081031104514/http://www.parssport.ir/football/iran/iran%20pro%20league/1373.htm|وبگاه=web.archive.org|تاریخ=2008-10-31|بازبینی=2020-11-20}}</ref>
}}</ref>
}}</ref> برابر سایپا قرار گرفت و با یک گل بازی را واگذار کرد.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=Www.ParsSport.Ir|نشانی=https://web.archive.org/web/20081031104514/http://www.parssport.ir/football/iran/iran%20pro%20league/1373.htm|وبگاه=web.archive.org|تاریخ=2008-10-31|بازبینی=2020-11-20}}</ref> در طول این فصلفصل، نیمکتسرمربی تیم چند بار دستخوشتغییر دگرگونی شدکرد. استقلال این مسابقات را با رضا نعلچگر آغاز کرد اما در ادامه [[لئونید بیلفسکی]] جایگزین او شد. در میانه بازیهای لیگ نیز [[نصرالله عبداللهی]] با کمک [[بهتاش فریبا]] هدایت استقلال را به دست گرفت و تیم را تا آستانهٔ قهرمانی پیش برد.<ref name="عملکرد" /> ▼
استقلال در گام آخر با تیمی تضعیفشده (بهواسطهٔ محرومیتها) پای به فینال مسابقات گذاشت و در پایان به نایب قهرمانی رسید.<ref name="ادوارآزادگان" /> استقلال در فینال بدون بازیکنان محروم خود (قلعهنویی، ورمزیار، فکری و غفوریهای اصل)<ref>{{یادکرد وب
| نشانی = http://www.goal.com/iran/news/1825/ایران/2011/11/27/2776578/گزارش-ویژه-گل-مروری-بر-محرومیت-ها
با آغاز [[باشگاه فوتبال استقلال تهران در فصل ۷۵–۱۳۷۴|فصل ۷۵−۱۳۷۴]] دگرگونیها در استقلال همچنان ادامه داشت و بار دیگر منصور پورحیدری به جای عبداللهی هدایت استقلال را بر عهده گرفت. [[لیگ آزادگان ۱۳۷۴|لیگ پنجم آزادگان]] از اردیبهشت تا بهمن ۱۳۷۴ برگزار شد که در پایان استقلال در جایگاه سوم قرار گرفت. ستارهٔ آبیپوشان در این فصل [[علیرضا منصوریان|علیرضا منصوریان]] بود که از پارسخودرو به استقلال آمده بود.<ref name="ادوارآزادگان" />
| عنوان = مروری بر تاریخ محرومیتهای فوتبالی در ایران
| تاریخ بازدید =
| نویسنده =
| تاریخ = ۲۷ نوامبر ۲۰۱۱
| ناشر = وبگاه گل
| زبان =
| نشانی بایگانی = https://www.webcitation.org/6Eqk6u6MF?url=http://www.goal.com/iran/news/1825/%D8%A7%DB%8C%D8%B1%D8%A7%D9%86/2011/11/27/2776578/%DA%AF%D8%B2%D8%A7%D8%B1%D8%B4-%D9%88%DB%8C%DA%98%D9%87-%DA%AF%D9%84-%D9%85%D8%B1%D9%88%D8%B1%DB%8C-%D8%A8%D8%B1-%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%88%D9%85%DB%8C%D8%AA-%D9%87%D8%A7
| تاریخ بایگانی = 3 مارس 2013
▲}}</ref> برابر سایپا قرار گرفت و با یک گل بازی را واگذار کرد.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=Www.ParsSport.Ir|نشانی=https://web.archive.org/web/20081031104514/http://www.parssport.ir/football/iran/iran%20pro%20league/1373.htm|وبگاه=web.archive.org|تاریخ=2008-10-31|بازبینی=2020-11-20}}</ref> در طول این فصل نیمکت تیم چند بار دستخوش دگرگونی شد. استقلال این مسابقات را با رضا نعلچگر آغاز کرد اما در ادامه [[لئونید بیلفسکی]] جایگزین او شد. در میانه بازیهای لیگ نیز [[نصرالله عبداللهی]] با کمک [[بهتاش فریبا]] هدایت استقلال را به دست گرفت و تیم را تا آستانهٔ قهرمانی پیش برد.<ref name="عملکرد" />
با آغاز [[باشگاه فوتبال استقلال تهران در فصل ۷۵–۱۳۷۴|فصل ۷۵−۱۳۷۴]] دگرگونیها در استقلال همچنان ادامه داشت و بار دیگر منصور پورحیدری به جای عبداللهی هدایت استقلال را بر عهده گرفت. [[لیگ آزادگان ۱۳۷۴|لیگ پنجم آزادگان]] از اردیبهشت تا بهمن ۱۳۷۴ برگزار شد که در پایان استقلال در جایگاه سوم قرار گرفت. ستارهٔ آبیپوشان در این فصل [[علیرضا منصوریان|علیرضا منصوریان]] بود که از پارس خودرو به استقلال آمده بود.<ref name="ادوارآزادگان" /> استقلال سپس در [[جام حذفی فوتبال ایران ۷۵–۱۳۷۴|مسابقات جام حذفی کشور]] با پیروزی برابر تیم [[باشگاه فوتبال برق شیراز|برق شیراز]] در [[فینال جام حذفی فوتبال ایران ۱۳۷۵|فینال بازیها]]، برای دومین بار و پس از ۱۹ سال قهرمان جام حذفی ایران شد. قهرمانی نخست استقلال در فصل ۵۶−۱۳۵۵ به دست آمده بود و پس از آن با وقوع انقلاب، جام حذفی کشور برای ۱۰ سال برگزار نشده بود.<ref name="حذفی">{{یادکرد وب |نشانی= http://www.hazfi-cup.com/Hazfi_Cup|عنوان=جام حذفی فوتبال ایران |تاریخ= |تاریخ بازدید= ۱۳ فروردین ۱۳۹۲| ناشر= وبگاه جام حذفی}}</ref>
=== آغاز مدیریت فتحاللهزاده ===
[[پرونده:Ali Fathollahzadeh.jpg|بندانگشتی|[[علی فتحاللهزاده|فتحاللهزاده]] در پاییز ۱۳۷۵ دوران طولانی [[فهرست مدیران باشگاه استقلال تهران|مدیریتش در استقلال]] را آغاز کرد تا تبدیل به یکی از افراد تاثیرگذار در تاریخ [[باشگاه فوتبال استقلال تهران|باشگاه استقلال]] شود.]]
[[باشگاه فوتبال استقلال تهران در فصل ۷۶–۱۳۷۵|استقلال در فصل ۷۶−۱۳۷۵]] در دورهٔ بعدی لیگ آزادگان که از تیر ۱۳۷۵ تا تیر ۱۳۷۶ و به مدت یک سال به درازا کشیدکشید، شرکت کرد و در پایان در ردهٔ ششم قرار گرفت<ref>{{یادکرد وب|عنوان=Iran 1996/97|نشانی=http://www.rsssf.com/tablesi/iran97.html|وبگاه=www.rsssf.com|بازبینی=2020-11-20}}</ref> که بدترین رتبهٔ این باشگاه در لیگ آزادگان و لیگهای سراسری ایران تا آن هنگام بود. در نیمفصل نخست این مسابقات شکست ۰−۱ استقلال در برابر پرسپولیس که پس از ۷ سال شکستناپذیری در شهرآورد تهران رقم خورد، پیامدهای بسیاری به همراه داشت. در پاییز ۱۳۷۵ [[علی فتحاللهزاده]] مدیر باشگاه استقلال شد.<ref name=":1" /> او ناصر حجازی را به سرمربیگری منصوب کرد.<ref name=":2">{{یادکرد وب|عنوان=استقلال بدون هفت بازیکن اصلی امروز عازم عربستان میشود|نشانی=https://images.hamshahrionline.ir/hamnews/1375/750901/VARZE49.HTM|وبگاه=images.hamshahrionline.ir|بازبینی=2020-11-20|نویسنده=|کد زبان=|تاریخ=}}</ref> با این حال استقلال که با مشکلات مالی فراوانی روبهرو بود، در ادامهٔ فصل نیز نمایش مطلوبی نداشت.<ref name="حاجی">{{یادکرد وب |نشانی=http://hamshahrimags.com/Images/News/AtachFile/16-8-1389/FILE634247426974923750.pdf |عنوان=بازگشت حاجی |تاریخ= |تاریخ بازدید=۱۳ فروردین ۱۳۹۲ |ناشر=[[همشهری ماه]]، مرداد ۱۳۸۹، صفحهٔ ۱۶ |archiveurl=https://web.archive.org/web/20110623074856/http://hamshahrimags.com/Images/News/AtachFile/16-8-1389/FILE634247426974923750.pdf |archivedate=۲۳ ژوئن ۲۰۱۱ |dead-url=yes }}</ref>
در رقابتهای آسیایی نیز استقلال پس از راهیابی به جمع چهار تیم برتر [[جام برندگان جام آسیا ۹۷–۱۹۹۶]]، در دیدار نیمهنهایی در [[ریاض]] عربستان برابر الهلال به میدان رفت که پس از تساوی ۰−۰ در پایان ۱۲۰ دقیقه وقتهای معمول و اضافه، در ضربههای پنالتی با نتیجهٔ ۴−۵ بازی را واگذار کرد.<ref>{{یادکرد وب |نشانی= http://www.hamshahrionline.ir/hamnews/1375/750906/varze47.htm|عنوان= استقلال شایستهٔ پیروزی بود، اما تنها یک اشتباه... |تاریخ= ۶ آذر ۱۳۷۵|تاریخ بازدید= ۱۳ فروردین ۱۳۹۲ | ناشر= روزنامه همشهری}}</ref> استقلال دیدار ردهبندی را نیز با نتیجه ۱–۰ به تیم [[باشگاه فوتبال اولسان هیوندای|اولسان هیوندای]] کره جنوبی واگذار کرد و به این ترتیب بدون گل زده در مرحله نهایی به مقام چهارمی بسنده کرد.<ref>{{یادکرد وب|نشانی=http://www.rsssf.com/tablesa/ascup97.html#cwc|عنوان=Cup Winners' Cup 1996/97|زبان=انگلیسی|ناشر=[[بنیاد آماری سند.ورزش.فوتبال]]|نویسنده=|کد زبان=|تاریخ=|وبگاه=}}</ref> این نتایج در حالی به دست آمد که استقلال چند بازیکن اصلیاش از جمله محمد تقوی، صادق ورمزیار، علیرضا منصوریان و محمدرضا مهرانپور را به دلایل مختلف در خدمت نداشت.<ref name=":2" />
=== قهرمانی در ایران ===
[[لیگ آزادگان ۷۷–۱۳۷۶|لیگ هفتم آزادگان]] از تیر ۱۳۷۶ با ۱۶ تیم آغاز شد اما به دلیل بیبرنامگیهابیبرنامگیها، با ۱۵ تیم به پایان رسید. در این فصل به دلیل درگیر بودن تیم ملی فوتبال ایران در بازیهای مقدماتی [[جام جهانی فوتبال ۱۹۹۸|جام جهانی ۱۹۹۸ فرانسه]]، روند برگزاری بازیها به کندی پیش رفت و ۱۳ ماه به طول انجامید. در میانهٔ بازیها نیز تیم پرسپولیس به دلیل حضور بازیکناناش در اردوی تیم ملی از لیگ آزادگان کنار کشید.<ref name="ادوارآزادگان"/> ناصر حجازی در [[باشگاه فوتبال استقلال تهران در فصل ۷۷–۱۳۷۶|این فصل]] ترکیب استقلال را جوانتر کرد. بازیکنانی چون [[فرهاد مجیدی]]، [[علیرضا اکبرپور|علیرضا اکبرپور]]، [[سرژیک تیموریان]]، [[فرد ملکیان]] و... به تیم اضافه شدند و استقلال چهرهای جوانتر به خود گرفت.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=HAMSHAHRI (Persian Daily)|نشانی=https://images.hamshahrionline.ir/hamnews/1376/760509/VARZE32.HTM|وبگاه=images.hamshahrionline.ir|بازبینی=2020-11-20}}</ref> در این فصل امیر قلعهنویی پس از خداحافظی از فوتبال و آویختن کفشها، به عنوان دستیار ناصر حجازی بر روی نیمکت استقلال نشست.<ref name="حاجی"/> در پایان این لیگ طولانیطولانی، استقلال با ۱۷ برد، ۹ مساوی و ۲ باخت، جام قهرمان دورهٔ هفتم لیگ آزادگان را از آن خود کردشد.<ref>{{یادکرد وب |نشانی= http://sss87.persiangig.com/Baziha/Azadegan/Fasle_76-77.htm|عنوان=بازیهای تیم استقلال تهران، فصل ۷۷−۱۳۷۶|تاریخ= |تاریخ بازدید= ۱۴ فروردین ۱۳۹۲| ناشر=}}</ref>
در این فصلفصل، به دلیل فشردگی بازیهای مقدماتی جام جهانی ۱۹۹۸ و سپس برگزاری اردوهای تیم ملی جام حذفی برگزار نشد و استقلال در تعطیلات این فصل در دو جام دوستانه خزر و [[جام پرزیدنت ترکمنستان ۱۹۹۸|پرزیدنت ترکمنستان]] شرکت کرد و توانست عنوان قهرمانی هر دو جام را به دست آورد.<ref>{{یادکرد کتاب|عنوان=تاریخچه کامل باشگاه از دوچرخه سواران و تاج تا استقلال|نام خانوادگی=احمدی|نام=علیاکبر|ناشر=انتشارات پایگان|سال=۱۳۸۸|شابک=۹۷۸-۶۰۰-۵۰۹۶-۵۷-۶|مکان=تهران|صفحات=۶۴۶}}</ref><ref>{{یادکرد کتاب|عنوان=تاریخچه کامل باشگاه از دوچرخه سواران و تاج تا استقلال|نام خانوادگی=احمدی|نام=علیاکبر|ناشر=انتشارات پایگان|سال=۱۳۸۸|شابک=۹۷۸-۶۰۰-۵۰۹۶-۵۷-۶|مکان=تهران|صفحات=۶۴۷}}</ref> استقلال در دیدار فینال جام پرزیدنت ترکمنستان توانست در ضربات پنالتی از سد تیم [[باشگاه فوتبال زنیت سن پترزبورگ|زنیت سن پترزبورگ]] بگذرد.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=HAMSHAHRI (Persian Daily)|نشانی=https://images.hamshahrionline.ir/hamnews/1376/761202/VARZE60.HTM|وبگاه=images.hamshahrionline.ir|بازبینی=2020-08-05}}</ref>
=== نائب قهرمانی در آسیا ===
|