پژوهشگاه فضایی ایران دارای ۵ پژوهشکده شامل دو پژوهشکدهپژوهشکدهٔ سیستمی به نام سامانه‌های ماهواره و سامانه‌های حمل و نقلحمل‌ونقل فضایی در تهران، سه پژوهشکده در مراکز استانی با عناوین رانشگرهای فضایی، مکانیک و مواد و انرژی به ترتیب در تبریز، شیراز و اصفهان و یک مرکز تحقیقاتی است.
=== پژوهشکدهپژوهشکدهٔ سامانه‌های حمل و نقل فضایی ===
این پژوهشکده از سال ۱۳۶۲ در عرصه‌های مختلف علمی و فنی به اجرای پروژه‌های متنوع کاربردی در راستای نیازهای ملی فعالیت داشته و از سال ۱۳۸۹ به [[سازمان فضایی ایران]] انتقال یافته‌است. پژوهشکدهپژوهشکدهٔ سامانه‌های حمل‌ونقل فضایی در حال حاضر یکی از پژوهشکده‌های سیستمی پژوهشگاه فضایی ایران می‌باشد.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=پژوهشگاه فضایی ایران {{!}} پژوهشکده حمل و نقل فضایی|نشانی=https://isrc.ac.ir/fa/%D9%BE%DA%98%D9%88%D9%87%D8%B4%DA%A9%D8%AF%D9%87-%D9%87%D8%A7/%D9%BE%DA%98%D9%88%D9%87%D8%B4%DA%A9%D8%AF%D9%87-%D8%AD%D9%85%D9%84-%D9%88-%D9%86%D9%82%D9%84-%D9%81%D8%B6%D8%A7%DB%8C%DB%8C|وبگاه=isrc.ac.ir|بازبینی=2021-05-31}}</ref>
=== پژوهشکدهپژوهشکدهٔ سامانه‌های ماهواره ===
پژوهشکدهپژوهشکدهٔ تحقیقات فضایی در سازمان فضایی ایران، با مجوز [[شورای گسترش آموزش عالی]]، به منظور پاسخ گوییپاسخگویی به بخشی از نیازهای پژوهشی کشور در زمینهزمینهٔ فناوری‌های فضایی در سال ۱۳۸۶ راه اندازیراه‌اندازی شد و اینک با عنوان پژوهشکدهپژوهشکدهٔ سامانه‌های ماهواره در پژوهشگاه فضایی ایران فعالیت دارد. از وظایف اصلی این پژوهشکده اجرای طرح‌های پژوهشی، کاربردی و توسعه ایتوسعه‌ای در علوم و فناوری فضایی و مطالعه، طراحی و ساخت ماهواره‌های سنجشی و مخابراتی است.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=پژوهشگاه فضایی ایران {{!}} پژوهشکده سامانه های ماهواره|نشانی=https://isrc.ac.ir/fa/%D9%BE%DA%98%D9%88%D9%87%D8%B4%DA%A9%D8%AF%D9%87-%D9%87%D8%A7/%D9%BE%DA%98%D9%88%D9%87%D8%B4%DA%A9%D8%AF%D9%87-%D8%B3%D8%A7%D9%85%D8%A7%D9%86%D9%87-%D9%87%D8%A7%DB%8C-%D9%85%D8%A7%D9%87%D9%88%D8%A7%D8%B1%D9%87|وبگاه=isrc.ac.ir|بازبینی=2021-05-31}}</ref>
=== پژوهشکدهپژوهشکدهٔ رانشگرهای فضایی ===
در راستای نیل به خودکفایی و استقلال کشور و لزوم رفع مشکلات فنی مهندسی، زمینه‌های مستعد و مساعد از قبیل وجود دانشگاه‌ها، کارخانجات، شرکت‌های صنعتی و امکانات بالقوه و بالفعل در استان آذربایجان شرقی، مرکز تحقیقات مهندسی در آذربایجان شرقی از سال ۱۳۶۴ فعالیت خود را آغاز نمود. این مرکز در سال ۱۳۹۰ در پژوهشگاه فضایی ا یرانایران با عنوان پژوهشکدهپژوهشکدهٔ رانشگرهای فضایی ارتقاء یافته و ادامهادامهٔ فعالیت می‌دهد.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=پژوهشگاه فضایی ایران {{!}} پژوهشکده رانشگرهای فضایی|نشانی=https://isrc.ac.ir/fa/%D9%BE%DA%98%D9%88%D9%87%D8%B4%DA%A9%D8%AF%D9%87-%D9%87%D8%A7/%D9%BE%D8%B2%D9%88%D9%87%D8%B4%DA%A9%D8%AF%D9%87-%D9%BE%D9%86%D8%AC%D9%85|وبگاه=isrc.ac.ir|بازبینی=2021-05-31}}</ref>
=== پژوهشکدهپژوهشکدهٔ مواد و انرژی ===
پژوهشکدهپژوهشکدهٔ مواد و انرژی از پژوهشکده‌های پژوهشگاه فضایی ایران است که در اصفهان قرار دارد. حوزه‌های مأموریتی این پژوهشکده در مواد و فناوری‌های ساخت و شکل دهی،شکل‌دهی، مولدهای انرژی، آشکارسازها و ماشین آلاتماشین‌آلات و تجهیزات ویژه است.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=پژوهشگاه فضایی ایران {{!}} پژوهشکده مواد و انرژی|نشانی=https://isrc.ac.ir/fa/%D9%BE%DA%98%D9%88%D9%87%D8%B4%DA%A9%D8%AF%D9%87-%D9%87%D8%A7/%D9%BE%DA%98%D9%88%D9%87%D8%B4%DA%A9%D8%AF%D9%87-%D9%85%D9%88%D8%A7%D8%AF-%D9%88-%D8%A7%D9%86%D8%B1%DA%98%DB%8C|وبگاه=isrc.ac.ir|بازبینی=2021-05-31}}</ref>
=== پژوهشکدهپژوهشکدهٔ مکانیک ===
پژوهشکدهپژوهشکدهٔ مکانیک در سال ۱۳۶۵ با هدف تأمین بخشی از نیازهای فنی و مهندسی صنایع کشور و ارائهارائهٔ خدمات به این بخش‌ها در شیراز تأسیس شده‌است. سپس در سال ۱۳۸۹ با انتقال به سازمان فضایی ایران به پژوهشکده ارتقاء یافته و اکنون یکی از سه پژوهشکدهپژوهشکدهٔ استانی وابسته به پژوهشگاه فضایی ایران می‌باشد.<ref>{{یادکرد وب|عنوان=پژوهشگاه فضایی ایران {{!}} پژوهشکده مکانیک|نشانی=https://isrc.ac.ir/fa/%D9%BE%DA%98%D9%88%D9%87%D8%B4%DA%A9%D8%AF%D9%87-%D9%87%D8%A7/%D9%BE%DA%98%D9%88%D9%87%D8%B4%DA%A9%D8%AF%D9%87-%D9%85%DA%A9%D8%A7%D9%86%DB%8C%DA%A9|وبگاه=isrc.ac.ir|بازبینی=2021-05-31}}</ref>
