تأسیس گروه آموزشی معارف [[قرآن]] در سال ۱۳۸۳ و در همان سال پذیرش دانشجویان در رشته کارشناسی ارشد معارف قرآن آغاز شده‌است و در مقطع کارشناسی ارشد رشته فقه و مبانی حقوق (از سال ۱۳۹۳) و مقطع کارشناسی علوم قرآن و حدیث و مقطع دکتری فقه و مبانی حقوق اسلامی دانشجو می‌پذیرد.
== محکومیت دانشگاه غیردولتی مفید در هیات عمومی دیوان عدالت اداری==
در دادخواست شاکی آمده است: لازم به ذکر است که دانشگاه مفید موسسه‌ای غیردولتی است که مطابق اساسنامه جدید دانشگاه از ۵ عضو هیأت مؤسس آن ۴ نفر عضو یک خانواده هستند (۳ برادر و یک داماد که منتسب به یکی از مقامات سابق نظام هستند) و از ۱۱ عضو هیأت امنای آن ۴ نفر عضو همان خانواده هستند و ریاست دانشگاه هم از همان خانواده است. عضو پنجم هیأت مؤسس و سایر اعضای هیأت امنا که با نظر ریاست دانشگاه منصوب شده‌اند صرفاً جهت رعایت تشریفات وزارت علوم هستند و اختیار چندانی در تصمیمات موسسه ندارند. استثنا کردن چنین موسسه‌ای از رعایت قوانین جاری کشور مصداق بند ۹ اصل ۳ قانون اساسی جمهوری اسلامی و ایجاد تبعیض ناروا برای برخی افراد است. <ref>https://sdil.ac.ir/%D8%A2%D8%B1%D8%A7%DB%8C-%D9%88%D8%AD%D8%AF%D8%AA-%D8%B1%D9%88%DB%8C%D9%87-%D8%AF%D9%87%D9%87-%D8%A7%D9%88%D9%84-%D8%AE%D8%B1%D8%AF%D8%A7%D8%AF-1401/
