ویکی‌پدیا

کالیرین

کالیرین (انگلیسی: Kalirin) که با نام‌های پروتئین تعامل‌کننده با پروتئین مرتبط با هانتیگتون (HAPIP)، پروتئین دوو (DUO) و سرین/ترئونین پروتئین کیناز با دومِـین هومولوژی پلکسترین و دی‌بی‌ال هم شناخته می‌شود، یک پروتئین است که در انسان توسط ژن «KALRN» کدگذاری می‌شود.[۴][۵]

KALRN
ساختارهای موجود
PDBجستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگرKALRN, ARHGEF24, CHD5, CHDS5, DUET, DUO, HAPIP, TRAD, kalirin, RhoGEF kinase, kalirin RhoGEF kinase
شناسه‌های بیرونیOMIM: 604605 MGI: 2685385 HomoloGene: 57160 GeneCards: KALRN
هم‌ساخت‌شناسی
گونه‌هاانسانموش
Entrez

8997

545156

آنسامبل

ENSG00000160145

ENSMUSG00000061751

یونی‌پروت

O60229

A2CG49

RefSeq (mRNA)

NM_003947، NM_007064، NR_028136، XM_006713810، XM_006713811، XM_006713812، XM_006713813، XM_006713814، XM_011513279، XM_011513280، XM_011513281، XM_011513283، NM_001322988، NM_001322989، NM_001322990، NM_001322991، NM_001322992، NM_001322993، NM_001322994، NM_001322995، NM_001322996، NM_001322997، NM_001322998، NM_001322999، NM_001323000، NM_001323001، XM_017007429، XM_017007430، XM_017007434، XM_017007435، XM_024453811، NM_001388412، NM_001388413، NM_001388414، NM_001388415، NM_001388416، NM_001388417، NM_001388418، NM_001388419، NR_170952، NR_170953، XM_047449157، XM_047449158، XM_047449159، XM_047449160، XM_047449161، XM_047449162، XM_047449163، XM_047449164، XM_047449165 NM_001024660، NM_003947، NM_007064، NR_028136، XM_006713810، XM_006713811، XM_006713812، XM_006713813، XM_006713814، XM_011513279، XM_011513280، XM_011513281، XM_011513283، NM_001322988، NM_001322989، NM_001322990، NM_001322991، NM_001322992، NM_001322993، NM_001322994، NM_001322995، NM_001322996، NM_001322997، NM_001322998، NM_001322999، NM_001323000، NM_001323001، XM_017007429، XM_017007430، XM_017007434، XM_017007435، XM_024453811، NM_001388412، NM_001388413، NM_001388414، NM_001388415، NM_001388416، NM_001388417، NM_001388418، NM_001388419، NR_170952، NR_170953، XM_047449157، XM_047449158، XM_047449159، XM_047449160، XM_047449161، XM_047449162، XM_047449163، XM_047449164، XM_047449165

NM_177357، XM_006522363، XM_006522364، XM_006522370، XM_006522380، XM_006522381، XM_006522382، XM_006522383، XM_006522385، XM_006522386، XM_011245951، XM_011245952، XM_011245953، XM_011245954، XM_011245955، XM_011245956، XM_011245957، XM_011245958، XM_011245959، XM_011245960، XM_011245961، XM_011245963، XM_011245965، XM_011245966، XM_011245967، XM_011245968، XM_017317071، XM_017317072، XM_017317073، XM_017317074، XM_017317075، XM_017317076، XM_017317077، XM_017317079، XM_017317080، XM_017317081، XM_017317082، XR_001781844، XR_001781845، XM_030249190، XM_030249191، XM_030249192، XM_036160014، XM_036160016، XM_036160017، XM_036160019، XM_036160020، XM_036160021، XM_036160023 NM_001164268، NM_177357، XM_006522363، XM_006522364، XM_006522370، XM_006522380، XM_006522381، XM_006522382، XM_006522383، XM_006522385، XM_006522386، XM_011245951، XM_011245952، XM_011245953، XM_011245954، XM_011245955، XM_011245956، XM_011245957، XM_011245958، XM_011245959، XM_011245960، XM_011245961، XM_011245963، XM_011245965، XM_011245966، XM_011245967، XM_011245968، XM_017317071، XM_017317072، XM_017317073، XM_017317074، XM_017317075، XM_017317076، XM_017317077، XM_017317079، XM_017317080، XM_017317081، XM_017317082، XR_001781844، XR_001781845، XM_030249190، XM_030249191، XM_030249192، XM_036160014، XM_036160016، XM_036160017، XM_036160019، XM_036160020، XM_036160021، XM_036160023

RefSeq (پروتئین)

NP_001309917، NP_001309918، NP_001309919، NP_001309920، NP_001309921، NP_001309922، NP_001309923، NP_001309924، NP_001309925، NP_001309926، NP_001309927، NP_001309928، NP_001309929، NP_001309930، NP_003938، NP_008995، XP_006713873، XP_006713874، XP_006713875، XP_006713876، XP_006713877، XP_006713878، XP_011511581، XP_011511582، XP_011511583، XP_011511585، XP_011511587، XP_016862918، XP_016862919، XP_016862920، XP_016862921، XP_016862922، XP_016862923، XP_016862924، XP_024309579 NP_001019831، NP_001309917، NP_001309918، NP_001309919، NP_001309920، NP_001309921، NP_001309922، NP_001309923، NP_001309924، NP_001309925، NP_001309926، NP_001309927، NP_001309928، NP_001309929، NP_001309930، NP_003938، NP_008995، XP_006713873، XP_006713874، XP_006713875، XP_006713876، XP_006713877، XP_006713878، XP_011511581، XP_011511582، XP_011511583، XP_011511585، XP_011511587، XP_016862918، XP_016862919، XP_016862920، XP_016862921، XP_016862922، XP_016862923، XP_016862924، XP_024309579

NP_796331، XP_006522426، XP_006522427، XP_006522433، XP_006522443، XP_006522444، XP_006522445، XP_006522446، XP_006522448، XP_006522449، XP_011244253، XP_011244254، XP_011244255، XP_011244256، XP_011244257، XP_011244258، XP_011244259، XP_011244260، XP_011244261، XP_011244262، XP_011244263، XP_011244265، XP_011244267، XP_011244268، XP_011244269، XP_011244270، XP_017172560، XP_017172561، XP_017172562، XP_017172563، XP_017172564، XP_017172565، XP_017172566، XP_017172568، XP_017172569، XP_017172570، XP_017172571، XP_030105050، XP_030105051، XP_030105052، XP_036015907، XP_036015909، XP_036015910، XP_036015912، XP_036015913، XP_036015914، XP_036015916 NP_001157740، NP_796331، XP_006522426، XP_006522427، XP_006522433، XP_006522443، XP_006522444، XP_006522445، XP_006522446، XP_006522448، XP_006522449، XP_011244253، XP_011244254، XP_011244255، XP_011244256، XP_011244257، XP_011244258، XP_011244259، XP_011244260، XP_011244261، XP_011244262، XP_011244263، XP_011244265، XP_011244267، XP_011244268، XP_011244269، XP_011244270، XP_017172560، XP_017172561، XP_017172562، XP_017172563، XP_017172564، XP_017172565، XP_017172566، XP_017172568، XP_017172569، XP_017172570، XP_017172571، XP_030105050، XP_030105051، XP_030105052، XP_036015907، XP_036015909، XP_036015910، XP_036015912، XP_036015913، XP_036015914، XP_036015916

موقعیت (UCSC)ن/مChr : 33.79 – 34.39 Mb
جستجوی PubMed[۲][۳]
ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسانمشاهده/ویرایش موش

کالیرین نخستین بار، در سال ۱۹۹۷ میلادی، به‌عنوان یک پروتئین تعامل‌کننده با «پروتئین مرتبط با هانتیگتون ۱» شناسایی شد.[۴] این ژن، نقش مهمی در رشد سلول‌های عصبی و تکامل آکسونی ایفا می‌کند.[۶]

نام این پروتئین برگرفته از ایزدبانوی هندی کالی است که چندین دست داشته و قادر است با پروتئین‌های بسیاری تعامل داشته باشد.

چند ایزوفرم مختلف از این ژن توسط پدیدهٔ «پیرایش دگرسان» تولید می‌شود.[۷] یکی از این ایزوفرم‌ها به نامِ «کالیرین ۷» برای بازآرایی سیناپس‌های عصبی در کورتکس مغز بالغین ضروری است و نقش مهمی در بروز اسکیزوفرنی ایفا می‌کند.[۸][۹][۱۰][۱۱] این موضوع را با از بین بردن این ژن در موش‌های بالغ و بروز علائم شبه اسکیزوفرنی در آنان، نشان داده‌اند.[۱۲] بیماری آلزایمر هم احتمالاً با «کالیرین ۷» در ارتباط است.[۱۱][۱۳][۱۴]

منابع ویرایش

  1. ↑ ۱٫۰ ۱٫۱ ۱٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000061751 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ↑ ۴٫۰ ۴٫۱ Colomer V, Engelender S, Sharp AH, Duan K, Cooper JK, Lanahan A, Lyford G, Worley P, Ross CA (September 1997). "Huntingtin-associated protein 1 (HAP1) binds to a Trio-like polypeptide, with a rac1 guanine nucleotide exchange factor domain". Hum. Mol. Genet. 6 (9): 1519–25. doi:10.1093/hmg/6.9.1519. PMID 9285789.
  5. ↑ Kawai T, Sanjo H, Akira S (February 1999). "Duet is a novel serine/threonine kinase with Dbl-Homology (DH) and Pleckstrin-Homology (PH) domains". Gene. 227 (2): 249–55. doi:10.1016/S0378-1119(98)00605-2. PMID 10023074.
  6. ↑ Chakrabarti K, Lin R, Schiller NI, Wang Y, Koubi D, Fan YX, Rudkin BB, Johnson GR, Schiller MR (June 2005). "Critical role for Kalirin in nerve growth factor signaling through TrkA". Mol. Cell. Biol. 25 (12): 5106–18. doi:10.1128/MCB.25.12.5106-5118.2005. PMC 1140581. PMID 15923627.
  7. ↑ McPherson CE, Eipper BA, Mains RE (February 2002). "Genomic organization and differential expression of Kalirin isoforms". Gene. 284 (1–2): 41–51. doi:10.1016/S0378-1119(02)00386-4. PMID 11891045.
  8. ↑ Xie Z, Srivastava DP, Photowala H, Kai L, Cahill ME, Woolfrey KM, Shum CY, Surmeier DJ, Penzes P (2007). "Kalirin-7 controls activity-dependent structural and functional plasticity of dendritic spines". Neuron. 56 (4): 640–56. doi:10.1016/j.neuron.2007.10.005. PMC 2118058. PMID 18031682.
  9. ↑ Ma XM, Kiraly DD, Gaier ED, Wang Y, Kim EJ, Levine ES, Eipper BA, Mains RE (November 2008). "Kalirin-7 is required for synaptic structure and function". Journal of Neuroscience. 28 (47): 12368–82. doi:10.1523/JNEUROSCI.4269-08.2008. PMC 2586970. PMID 19020030.
  10. ↑ Sommer JE, Budreck EC (April 2009). "Kalirin-7: linking spine plasticity and behavior". Journal of Neuroscience. 29 (17): 5367–9. doi:10.1523/JNEUROSCI.0235-09.2009. PMC 2684031. PMID 19403804.
  11. ↑ ۱۱٫۰ ۱۱٫۱ Penzes P, Jones KA (August 2008). "Dendritic spine dynamics--a key role for kalirin-7". Trends in Neurosciences. 31 (8): 419–427. doi:10.1016/j.tins.2008.06.001. PMID 18597863.
  12. ↑ Cahill ME, Xie Z, Day M, Barbolina MV, Miller CA, Weiss C, Radulovic J, Sweatt JD, Disterhoft JF, Surmeier DJ, Penzes P (July 2009). "Kalirin regulates cortical spine morphogenesis and disease-related behavioral phenotypes". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106 (31): 13058–63. doi:10.1073/pnas.0904636106. PMC 2722269. PMID 19625617.
  13. ↑ Youn H, Ji I, Ji HP, Markesbery WR, Ji TH (November 2007). "Under-expression of Kalirin-7 Increases iNOS activity in cultured cells and correlates to elevated iNOS activity in Alzheimer's disease hippocampus". J. Alzheimers Dis. 12 (3): 271–81. PMID 18057561.
  14. ↑ Youn H, Jeoung M, Koo Y, Ji H, Markesbery WR, Ji I, Ji TH (June 2007). "Kalirin is under-expressed in Alzheimer's disease hippocampus". J. Alzheimers Dis. 11 (3): 385–97. PMID 17851188.
 

این یک مقالهٔ خرد آنزیم ، پروتئین یا زیست‌مولکول است. می‌توانید با گسترش آن به ویکی‌پدیا کمک کنید.

 

این یک مقالهٔ خرد زیست‌شناسی مولکولی است. می‌توانید با گسترش آن به ویکی‌پدیا کمک کنید.

برگرفته از «https://fa.wikipedia.org/w/index.php?title=کالیرین&oldid=35662451»