تکرار غنی از لوسین
تکرارهای غنی از لوسین (انگلیسی: Leucine-rich repeats) یک موتیف ساختاری پروتئین است که یک چین (تاشدگی) نعل‌اسبی α/β تشکیل می‌دهد.[۱][۲] این موتیف از توالی تکرارشوندهٔ ۲۰ تا ۳۰ اسید آمینه تشکیل شده‌است که معمولاً دارای اسید آمینهٔ آب‌گریزِ «لوسین» است. این توالی تکراری معمولاً در هم چین می‌خورند و یک دومِـین سلنوئیدی پروتئین را می‌سازند که به آن اصطلاحاً «دومین تکرارشوندهٔ غنی از لوسین» می‌گویند. هر واحد تکرارشونده به‌طور رایج دارای ساختارِ «صفحه بتا-چرخش-مارپیچ آلفا» است و دومین ایجادشده هم دارای توالی تکرارشوندهٔ فراوان و شکلی نعل‌اسبی با یک صفحهٔ بتای موازی داخلی و مارپیچ‌های خارجی است. یک سمت از صفحهٔ بتا و مارپیچ در معرض حلال‌ها بوده و در نتیجه مملو از باقی‌مانده‌های آب‌دوست است. ناحیهٔ بین صفحات بتا و مارپیچ‌ها هم هستهٔ مرکزیِ آب‌گریزِ است که از لحاظ فضایی، به‌طور متراکمی از باقی‌مانده‌های لوسین احاطه شده‌است.
 مثالی از یک پروتئین حاویِ توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین، یک بازدارنده ریبونوکلئاز در خوک | |||||||||||
| شناسه‌ها | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| نماد | LRR_1 | ||||||||||
| پی‌فم | PF00560 | ||||||||||
| پی‌فم clan | CL0022 | ||||||||||
| اینترپرو | IPR001611 | ||||||||||
| SCOPe | 2bnh / SUPFAM | ||||||||||
| OPM protein | 1xwd | ||||||||||
| |||||||||||
| یک گونه از توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 یک گونه از توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین با یک ساختار جدید از پروتئین های تکرارشونده | |||||||||
| شناسه‌ها | |||||||||
| نماد | LRV | ||||||||
| پی‌فم | PF01816 | ||||||||
| پی‌فم clan | CL0020 | ||||||||
| اینترپرو | IPR004830 | ||||||||
| SCOPe | 1lrv / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| توالی غنی از لوسین | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 اینترنالین اچ: ساختار کریستالی از دومین‌های آمیدی متصل‌به‌هم. | |||||||||
| شناسه‌ها | |||||||||
| نماد | LRR_adjacent | ||||||||
| پی‌فم | PF08191 | ||||||||
| اینترپرو | IPR012569 | ||||||||
| |||||||||
| دومین انتهای آمینی غنی از توالی لوسین | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 دکورین دایمریک استخراج شده از بافت‌های گاوی، فُرم کریستالی ۲ | |||||||||
| شناسه‌ها | |||||||||
| نماد | LRRNT | ||||||||
| پی‌فم | PF01462 | ||||||||
| اینترپرو | IPR000372 | ||||||||
| SMART | LRRNT | ||||||||
| SCOPe | 1m10 / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| دومین انتهای آمینی غنی از توالی لوسین | |
|---|---|
 ساختار کریستالی پروتئین مهارکنندهٔ پلی‌گالاکتوروناز (pgip)، نوعی پروتئین حاوی توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین که در دفاعِ ایمنی گیاهان نقش دارد. | |
| شناسه‌ها | |
| نماد | LRRNT_2 |
| اینترپرو | IPR013210 |
| SMART | LRRNT |
| SCOPe | 1m10 / SUPFAM |
| دومین ابتدایی کربوکسیلی غنی از توالی لوسین | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 سومین دومِـین lrr در پروتئینِ slit مگس سرکه | |||||||||
| شناسه‌ها | |||||||||
| نماد | LRRCT | ||||||||
| پی‌فم | PF01463 | ||||||||
| اینترپرو | IPR000483 | ||||||||
| SMART | LRRCT | ||||||||
| SCOPe | 1m10 / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| مجموعهٔ FeS4 از پروتئین LRV | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
یک گونه از توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین با یم ساختار جدید از پروتئین های تکرارشونده | |||||||||
| شناسه‌ها | |||||||||
| نماد | LRV_FeS | ||||||||
| پی‌فم | PF05484 | ||||||||
| پی‌فم clan | CL0020 | ||||||||
| اینترپرو | IPR008665 | ||||||||
| SCOPe | 1lrv / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
توالی غنی از لوسین بیشتر در ایجاد تعامل پروتئین-پروتئین نقش دارد.[۳][۴]
منابع
ویرایش- ↑ Kobe B, Deisenhofer J (October 1994). "The leucine-rich repeat: a versatile binding motif". Trends Biochem. Sci. 19 (10): 415–21. doi:10.1016/0968-0004(94)90090-6. PMID 7817399.
- ↑ Enkhbayar P, Kamiya M, Osaki M, Matsumoto T, Matsushima N (February 2004). "Structural principles of leucine-rich repeat (LRR) proteins". Proteins. 54 (3): 394–403. doi:10.1002/prot.10605. PMID 14747988.
- ↑ Kobe B, Kajava AV (December 2001). "The leucine-rich repeat as a protein recognition motif". Curr. Opin. Struct. Biol. 11 (6): 725–32. doi:10.1016/S0959-440X(01)00266-4. PMID 11751054.
- ↑ Gay NJ, Packman LC, Weldon MA, Barna JC (October 1991). "A leucine-rich repeat peptide derived from the Drosophila Toll receptor forms extended filaments with a beta-sheet structure". FEBS Lett. 291 (1): 87–91. doi:10.1016/0014-5793(91)81110-T. PMID 1657640.
- مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «Leucine-rich repeat». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۲۴ دسامبر ۲۰۱۷.
بیشتر بخوانید
ویرایش- Tooze, John; Brändén, Carl-Ivar (1999). Introduction to Protein Structure (2nd ed.). New York: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0.
- Wei T, Gong J, Jamitzky F, Heckl WM, Stark RW, Roessle SC (November 2008). "LRRML: a conformational database and an XML description of leucine-rich repeats (LRRs)". BMC Struct. Biol. 8 (1): 47. doi:10.1186/1472-6807-8-47. PMC 2645405. PMID 18986514.
پیوند به بیرون
ویرایش- ردهٔ موتیفی LIG_SCF_Skp2-Cks1_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
 | این یک مقالهٔ خرد زیست‌شناسی مولکولی است. می‌توانید با گسترش آن به ویکی‌پدیا کمک کنید. |