تکرار WD40

ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary
پی‌دی‌بی	1b9x, 1b9y, 1erj, 1gg2, 1got, 1gp2, 1gxr, 1nex, 1nr0, 1omw, 1p22, 1pev, 1pgu, 1pi6, 1s4u, 1sq9, 1tbg, 1u4c, 1xhm, 1yfq, 2bcj, 2ce8, 2ce9, 2trc

دومینِ WD40، تکرار جی-بتا
دومینِ WD40، تکرار جی-بتا
	تصویر شماتیک نواری‌شکل از انتهای کربوکسیل دومینِ WD40 از Tup1 (یک پروتئین هم‌سرکوب‌گر در مخمر) که دارای یک تاخوردگی بتا-پروپلر هفت تیغه‌ای است. نوارها از آبی (انتهای آمینی) تا قرمز (انتهای کربوکسیل) رنگ شده‌اند.
شناسه‌ها
نماد	WD40
پی‌فم	PF00400
پی‌فم clan	CL0186
اینترپرو	IPR001680
PROSITE	PDOC00574
SCOPe	1gp2 / SUPFAM
سی‌دی‌دی	cd00200
پی‌فم
ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary
پی‌دی‌بی	1b9x, 1b9y, 1erj, 1gg2, 1got, 1gp2, 1gxr, 1nex, 1nr0, 1omw, 1p22, 1pev, 1pgu, 1pi6, 1s4u, 1sq9, 1tbg, 1u4c, 1xhm, 1yfq, 2bcj, 2ce8, 2ce9, 2trc

تکرار WD40 (انگلیسی: WD40 repeat) که با نام تکرار بتا-ترانسدوسین هم شناخته می‌شود، یک موتیف ساختاری کوتاه متشکل از ۴۰ اسید آمینه است که اغلب به یک پایانهٔ دو پپتیدی از اسید آسپارتیک و تریپتوفان ختم می‌شود.^[۲]

نسخه‌های مجاور هم معمولاً با تا خوردن در کنار هم، یک دومین سلونوئیدیِ حلقوی به نام دومینِ WD40 می‌سازند.

پروتئین‌های تکرار WD40، خانوادهٔ بزرگی از پروتئین‌ها هستند که در تمامی یوکاریوت‌ها یافت می‌شوند و در بسیاری از فعالیت‌های مهم سلولی نظیر ترارسانی پیام، کنترل چرخه یاخته‌ای، خودخواری، تنظیم نسخه‌برداری ژن، و خزان یاخته‌ای نقش دارند.^[۳]

بنا به بررسی‌های انجام شده در ژنوم انسان، تکرارهای WD40، هشتمین خانوادهٔ بزرگ پروتئینی در انسان است که در ۲۷۷ پروتئین موجود است.^[۴]

منابع ویرایش

↑ پی‌دی‌بی 1erj; Sprague ER, Redd MJ, Johnson AD, Wolberger C (June 2000). "Structure of the C-terminal domain of Tup1, a corepressor of transcription in yeast". EMBO J. 19 (12): 3016–27. doi:10.1093/emboj/19.12.3016. PMC 203344. PMID 10856245.
↑ Neer EJ, Schmidt CJ, Nambudripad R, Smith TF (September 1994). "The ancient regulatory-protein family of WD-repeat proteins". Nature. 371 (6495): 297–300. doi:10.1038/371297a0. PMID 8090199.
↑ Stirnimann CU, Petsalaki E, Russell RB, Müller CW (May 2010). "WD40 proteins propel cellular networks". Trends Biochem. Sci. 35 (10): 565–74. doi:10.1016/j.tibs.2010.04.003. PMID 20451393.
↑ Lander ES, Linton LM, Birren B, et al. (February 2001). "Initial sequencing and analysis of the human genome" (PDF). Nature. 409 (6822): 860–921. doi:10.1038/35057062. PMID 11237011.

مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «WD40 repeat». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۱۹ ژانویه ۲۰۱۹.

پیوند به بیرون ویرایش

ردهٔ موتیفی LIG_APCC_Dbox_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_APCC_KENbox_2 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_COP1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_CRL4_Cdt2_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_CRL4_Cdt2_2 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_EH1_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_GLEBS_BUB3_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_RAPTOR_TOS_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_SCF_FBW7_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_SCF_FBW7_2 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_SCF-TrCP1_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_WRPW_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی LIG_WRPW_2 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی TRG_ER_diArg_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی TRG_ER_diLys_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی TRG_Golgi_diPhe_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک
ردهٔ موتیفی TRG_PTS2 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک

[pmid10856245-1] پی‌دی‌بی 1erj; Sprague ER, Redd MJ, Johnson AD, Wolberger C (June 2000). "Structure of the C-terminal domain of Tup1, a corepressor of transcription in yeast". EMBO J. 19 (12): 3016–27. doi:10.1093/emboj/19.12.3016. PMC 203344. PMID 10856245.

[pmid8090199-2] Neer EJ, Schmidt CJ, Nambudripad R, Smith TF (September 1994). "The ancient regulatory-protein family of WD-repeat proteins". Nature. 371 (6495): 297–300. doi:10.1038/371297a0. PMID 8090199.

[pmid20451393-3] Stirnimann CU, Petsalaki E, Russell RB, Müller CW (May 2010). "WD40 proteins propel cellular networks". Trends Biochem. Sci. 35 (10): 565–74. doi:10.1016/j.tibs.2010.04.003. PMID 20451393.

[pmid11237011-4] Lander ES, Linton LM, Birren B, et al. (February 2001). "Initial sequencing and analysis of the human genome" (PDF). Nature. 409 (6822): 860–921. doi:10.1038/35057062. PMID 11237011.

[۲]

[۱]

[۳]

[۴]