دومین PIN (انگلیسی: PIN domain) یک دومین پروتئین است که طول آن ۱۳۰ اسید آمینه است و به‌صورت یک آنزیم نوکلئاز عمل می‌کند و آران‌ای تک‌رشته‌ای را می‌شکند.[۱][۲]

PIN domain
ساختار کریستالی دومین PIN در آرکئوگلوبوس فولجیدوس. 1o4w
شناسه‌ها
نمادPIN
پی‌فمPF01850
اینترپروIPR002716
SMARTCBS
SCOPe3dbo / SUPFAM
سی‌دی‌دیcd09852

این دومِـین پروتئینی، ۴ ریشهٔ اسیدی پایدار دارد.[۲] ساختارهای کریستالی نشان می‌دهند که این ریشه‌ها در یک جایگاه فرضی فعال، در کنار هم جمع می‌شوند. در یوکاریوت‌ها، این دومین در پروتئین‌هایی یافت می‌شود که در فراوری «آران‌ای ریبوزومی 18S» و همچنین فرایند سلولی Nonsense-mediated decay نقش دارند؛ مانند SMG5 و SMG6.

در پروکاریوت‌ها این دومین، بخشی از سیستم توکسین-آنتی‌توکسین است.[۲] این جایگاه‌ها به موجودات اینچنینی اجازه می‌دهد با شرایط سخت کمبود غذا سازگاری پیدا کنند.[۳]

منابع ویرایش

  1. Arcus VL, McKenzie JL, Robson J, Cook GM (January 2011). "The PIN-domain ribonucleases and the prokaryotic VapBC toxin-antitoxin array". Protein Engineering, Design & Selection. 24 (1–2): 33–40. doi:10.1093/protein/gzq081. PMID 21036780.
  2. ۲٫۰ ۲٫۱ ۲٫۲ Matelska D, Steczkiewicz K, Ginalski K (July 2017). "Comprehensive classification of the PIN domain-like superfamily". Nucleic Acids Research. 45 (12): 6995–7020. doi:10.1093/nar/gkx494. PMC 5499597. PMID 28575517.
  3. Gerdes K, Christensen SK, Løbner-Olesen A (May 2005). "Prokaryotic toxin-antitoxin stress response loci". Nature Reviews. Microbiology. 3 (5): 371–82. doi:10.1038/nrmicro1147. PMID 15864262.